细胞系作为正常或肿瘤组织的模式细胞被广泛应用于科学研究和药物开发,然而很大一部分的细胞系被错误标记或被其它个体、组织、种系来源的细胞所替代 。
细胞系错误鉴定问题已有50年历史,基于国际细胞库的分析数据显示:1984年细胞错误鉴定率为35%,1999年为18%,直到zei近几年,应用于生物医学领域的细胞系需要鉴定的问题仍然很少有人关注。
细胞系错误鉴定所造成的后果:
1. 细胞系的损失
2. 时间和金钱的损失
3. 在公众领域(文献,专利等)提供错误信息
4. 造成实验结果不一致或不可重复
5. 个人:尴尬;公众:羞辱
STR(Short TandemRepeat,短串联重复序列)基因分型已被ICLAC、ATCC等权威机构作为金标准应用于细胞鉴定 。 STR基因位点由长度为3~7个碱基对的短串连重复序列组成, 这些重复序列广泛存在于人类基因组中,可作为高度多态性标记,被称为细胞的DNA指纹。STR 基因座位上的等位基因可通过扩增区域内重复序列的拷贝数的不同来区分,在毛细管电泳分离之后可通过荧光检测来识别。随后通过一定的计算方法,即可根据所得的STR分型结果与细胞STR数据库比对从而推算出样品所属的细胞系或可能的交叉污染的细胞系名称。
人源细胞STR位点信息
TH01
AMEL
TPOX
D3S1358
D12S391
D5S818
VWA
D13S317
D7S820
D2S1338
D8S1179
D6S1043
CSF1PO
D21S11
D19S433
D16S539
FGA
D18S51
PENTAD
PENTAE
上海翼和生物为了进一步提高鉴定的分辨率,除了包含ATCC检测的8个STR和1个性别决定位点Amelogenin外,另新增了11个高度多态性位点 ,共检测20个STR位点。
【1】Wang Y H, Wang J Q, Wang Q, et al. Endophilin B2 promotes inner mitochondrial membrane degradation by forming heterodimers with Endophilin B1 during mitophagy.[J]. Scientific Reports, 2016, 6.
【2】MoD, Fang H, Niu K, et al. Human helicase RECQL4 drives cisplatin resistance in gastric cancer by activating an AKT-YB1-MDR1 signaling pathway.[J]. Cancer Research, 2016.
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