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小RNA是一类长度在20-30nt的RNA分子,主要包括miRNA、siRNA和piRNA; 小RNA是生物体内一类重要的调控分子,调控基因的表达,参与生长发育,抵制非生物胁迫和病原菌的侵害等过程。
百迈客技术优势
高通量,低成本。
高准确性:读长覆盖小RNA全序列,产生的定量数据与实时定量PCR结果具有高度的一致性。 数字化信号:能够直接从单核苷酸水平研究小分子RNA,利于区分相同家族以及序列极为相似的不同小分子RNA。 通用的平台:可进行目标物种的小RNA序列测定,不需要前体序列信息或是二级结构信息。 丰富的信息学分析:可获得物种全基因组水平的miRNA图谱,实现新miRNA分子的挖掘、靶基因的预测和鉴定、样品间差异表达分析、miRNAs聚类和表达谱分析。
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数字化信号:能够直接从单核苷酸水平研究小分子RNA,利于区分相同家族以及序列极为相似的不同小分子RNA。
通用的平台:可进行目标物种的小RNA序列测定,不需要前体序列信息或是二级结构信息。
丰富的信息学分析:可获得物种全基因组水平的miRNA图谱,实现新miRNA分子的挖掘、靶基因的预测和鉴定、样品间差异表达分析、miRNAs聚类和表达谱分析。
生物信息学内容
基础分析: 原始数据去杂,聚类得到小RNA的单拷贝序列库,绘制小RNA长度分布图; 与参考基因组比对,绘制小RNA的全基因组分布图; 分级注释: 与Rfam库比对,注释ncRNA(如rRNA、tRNA、snoRNA、snRNA); 与miRBase库比对,注释已知的miRNA; 与RepBase库比对,注释重复序列; 与Exon/Intron比对,鉴定mRNA降解片段; 结构与功能分析: 预测新的miRNA,预测其二级结构图; miRNA核酸偏好性分析; miRNA靶基因预测,靶基因功能注释; 样品间miRNA的差异表达分析;
小RNA测序(miRNA图谱 小RNA差异表达),
小RNA测序(miRNA图谱 小RNA差异表达)信息由北京百迈客生物科技有限公司为您提供,如您想了解更多关于小RNA测序(miRNA图谱 小RNA差异表达)报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。
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