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技术简介: 指对环境细菌的16S rRNA进行高通量测序。16S rRNA结构既具有保守性,又具有高变性。通过测序结果与数据库比较,可以分析环境细菌的菌群结构和多样性。 生物信息分析: 1. 序列质量控制。 2. 操作分类单元(OTU)的划分 a) 按照序列数量生成OTU的丰度谱。 b) 基于OTU 丰度谱进行的样本比较,如层次聚类、主成分分析等。 c) 比较组间差异,找出贡献差异的OTU,阐述其生物学意义。 3. 物种分类的鉴定 a) 按照序列数量在不同层次生成物种分类的丰度谱,通常在门和属的水平进行。 比较组间差异,找出差异显著的分类单元,阐述其生物学意义。 送样要求:
16S rRNA基因测序,
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