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GBS(Genotyping-by-Sequencing)是指通过测序进行基因分型,其命名是为了与传统的通过芯片进行基因分型的方法相区别。原理是将基因组DNA进行酶切,然后对酶切片段两端序列进行高通量测序,通过分析获得SNP信息并进行基因分型,是一种快速、简便、低成本的基因分型方法,适合对大规模样品进行标记筛选。
1. 测序数据基本分析
2. tag产出数据统计
3. 个体tag聚类
4. 群体tag聚类
5. SNP 检测
1. 基因分型
2. 遗传图谱构建
3. QTL定位(需提供表型数据)
4. 遗传图谱整合(需提供同一作图群体原图谱数据)
1. 群体进化树分析(Phylogeny tree)
2. 群体结构分析(Structure)
3. 群体主要成分分析(PCA)
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