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如何在四极杆GC/MS上创建适用于NIST检索的精确质量谱库


MassWorks 质谱校准 绿绵

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  MassWorks的质谱校准技术已经被证实能够对四极杆GC/MS系统中的分子离子或碎片离子实现精确质量数与元素组成测定。这一通常仅在高分辨率质谱仪上才具备的能力,现可与NIST谱库检索相结合,以提高化合物鉴定的置信度。

  本文我们将介绍通过MassWorks校准技术在低分辨质谱上创建“GC/MS精确质量谱库”的新方法。不同于当前NIST谱库仅对分子离子和碎片离子采用整数质量精度的方式,这种新的谱库方法将扩大对无分子离子的化合物的应用范围,还将通过添加所有碎片离子的精确质量,增强对包含分子离子谱图的谱库检索性能,以获得更加准确的结果。

  精确质量数据采集方法

  图1显示了以安捷伦GC/MS为例的数据采集的设置方式,将GC/MS的采集方式选为轮廓(Profile)扫描模式,采样阈值Threshold设置为0,然后采集样品和PFTBA的数据。

  在MassWorks软件中打开PFTBA数据用于GC/MS精确质量数校正,然后将其应用于样品谱图,获取GC/MS精确质量谱图。

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图1 安捷伦GC/MS数据采集的设置方式

  创建“GC/MS精确质量谱库”

  创建精确质量GC/MS谱库的包括三个主要步骤:①从MassWorks导出精确质量谱图至NIST MS Search、②对导出的谱图进行编辑,③保存精确质量谱图至谱库。

  1. 从MassWorks导出精确质量谱图

  从MassWorks向NIST MS Search导出精确质量谱图的操作很简单。只需在MassWorks的质谱谱图窗口中单击右键,在弹出菜单(见图2)中选择“Library Search”,这时将执行常规的NIST谱库检索,精确质量谱图将从MassWorks导出至NIST MS Search,如图3所示,顶部的谱图是从MassWorks导入的精确质量谱图,下方的谱图则为NIST库中原有的整数质量谱图。在图3的左下方候选化合物列表窗口中选中正确的化合物,接着继续下一步谱图编辑操作。

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图2 从MassWorks软件导出精确质量谱图至NIST MS Search

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图3 NIST MS search中选中正确的化合物

  2. 编辑“精确质量谱图”

  1) 复制NIST谱库目标化合物的所有质谱图信息——将图3右下方“化合物信息”面板中复制并粘贴至一个txt格式的记事文本中,如图4所示。

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图4 粘贴化合物信息至txt文本

  2) 点击“Librarian”和“Names”标签,打开“Spectrum Information”窗口。选中列表顶部的化合物谱图,然后点击“ed”工具栏按钮(见图5),使Spectrum Information窗口出现(见图6)。

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图5 Librarian界面中选中精确质量谱图

  3)从txt记事本中选择性地复制信息并粘贴到“Spectrum Information”窗口,采用以下方式更新各字段内容:

  ①粘贴化合物的“名称”。

  ② 粘贴“CAS号”。

  ③ 输入分子式和分子量。

  ④ 结构式可由化合物的CAS号自动获取,或者直接粘贴结构图

  ⑤ 在“other name”中粘贴化合物的其它名称。

  ⑥在“Comments”中编写定制消息。

  ⑦点击“Replace”(见图6),更新该化合物谱图的所有信息。

  经过编辑后,精确质量谱图现在拥有包括名称、分子式、结构等在内的完整记录,并在谱列表窗口顶部以更新后的名称显示。

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图6 为精确质量谱图添加化合物信息

  3. 保存“精确质量谱图”至目标谱库

  在保存精确质量谱图前,需要事先新建一个谱库,如图7所示,点击“Create Library”按钮,为将要创建的谱库命名,例如“AM_nist”。

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图7 新建精确质量谱库

  在图6中,点击“Add to library”按钮,从弹出窗口(见图8)中选择已创建的库,例如“AM_nist”,点击“OK”完成。

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图8 选择谱库,将精确质量谱图添加至新的谱库

  成功创建精确质量谱库后,即可在MassWorks中对高质量精度的GC/MS谱图进行化合物的精确检索。在开始检索之前,需要通过“Library Search Options”将已创建的精确质量库纳入搜索范围。在NIST MS Search的“Option”主菜单项中,选择“Library Search Options”,点击“Libraries”标签,选择“am_nist”,然后点击“ Add”添加精确质量谱库至检索目标库(见图9)。

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图9 选择精确质量谱库用于检索

  精确质量谱库检索

  执行精确质量NIST库检索的操作与常规NIST库检索相同,如图2所示,在测试谱图中启动NIST检索,该谱图的检索结果如图10所示。

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图10 精确质量谱库检索结果

  尽管该化合物在整数质量谱库和精确质量谱库中均有发现,但使用精确质量谱库时,所有离子的精确质量匹配更接近实际测量值,精确质量谱库为检索提供了更好的质量准确性匹配,因此检索的匹配度比整数质量谱库更高,从而提高了鉴定结果的可靠性。

  基于MassWorks校准技术创建的精确质量谱库,可以显著增强GC/MS系统的鉴定能力,无论是对存在明显分子离子的化合物,或是对于那些不具备分子离子或存在同分异构体混淆情况的化合物。结合NIST谱库检索,这种精确质量谱库方法有助于研究人员准确、高效地鉴定复杂样品中的化合物,无论是在环境监测、风味分析、食品安全检测还是药物代谢研究等领域,都有广泛的应用潜力。

  关于MassWorks 软件

  MassWorks软件是由 Cerno Bioscience 公司开发的一款革命性的MS数据定性分析软件,能帮助我们在低分辨率的四极杆GC/MS、LC/MS直接测定化合物的精确质量,并通过独有的谱图准确度概念确定出准确的分子式。MassWorks软件同样适用于高分率质谱(TOF、Orbitrap)的定性分析。

  关于绿绵科技

  绿绵科技是Cerno Bioscience公司在中国区的总代理商,负责Cerno公司旗下的MassWorks、GC/ID 等产品市场推广、销售、售前/售后技术支持、应用支持。

  若您想了解获取 MassWorks 产品的更多信息或应用,欢迎致电绿绵科技!




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