多靶标, 高覆盖, TaqMan呼吸道病原微流体芯片 | 赛默飞助力新冠病毒检测攻坚

2023-02-13 13:23:19, ABI 赛默飞世尔科技生命科学产品


2019年12月以来,新冠病毒SARS-CoV-2疫情已在全球多个国家和地区流行。《关于印发新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行第六版)的通知》中提出,对疑似患者应尽可能使用抗原或多重PCR方法进行鉴别诊断。对此,赛默飞设计开发了针对新型冠状病毒的检测试剂,并已添加到呼吸道病原微流体芯片中,结合经典TaqMan探针和空间多重技术,这款微流体芯片可一次检测覆盖42种病原,这为尽早明确病原、精准用药、降低交叉感染或合并感染风险的发生提供了关键信息。

多靶标、高覆盖,赛默飞新冠病毒检测攻坚利器—TaqMan呼吸道病原微流体芯片

● 新型冠状病毒 

冠状病毒是自然界广泛存在的一类病毒,分为α、β、γ和δ四个属。截止目前,有7种冠状病毒可以感染人类。

包括四种引起轻症的冠状病毒:

• 冠状病毒229E (α属)

• 冠状病毒NL63 (α属)

• 冠状病毒OC43 (β属)           

• 冠状病毒HKU1 (β属)

以及三种引起重症的冠状病毒:

• SARS-CoV (β属)

• MERS-CoV (β属)

• 新型冠状病毒:SARS-CoV-2 (β属)

2019年12月以来,新冠病毒SARS-CoV-2感染导致的疫情在全球多个国家流行。

● 多重病原检测:明确病原、精准用药,降低交叉感染或合并感染

参考流行病学数据,呼吸道感染有两个特点:

1   病原谱复杂,上呼吸道通常以病毒感染为主,下呼吸道通常以病毒和/或细菌感染为主。季节影响显著,冬春季节病毒感染高发。病毒感染会引发细菌或真菌的继发感染;

2   混合感染,同一患者可能出现两重、三重甚至四重感染,临床诊疗困难。因此,以单一病原体为检测目的的检测方法不能满足临床需求。临床上需要广谱、迅速、准确的呼吸道病原体检测方案来识别病原体,以帮助判断病情,避免盲目用药。

数据来自《上海市2015-2017年成年人急性呼吸道感染病例的流行病学和病原学特征分析》 中华流行病学杂志2019年8月第49卷第8期

来自武汉人民医院《Clinical  diagnostics of 8247 samples with 2019-novel coronavirus in Wuhan》的文章中指出“104份新型冠状病毒阳性样本中,有5.8%(6/104)合并感染其他病毒。” “212份新型冠状病毒阴性样本中,其他病原体感染率为18.4%(39/212)

此外,呼吸道常见病原感染后的临床表现与新型冠状病毒肺炎相似,难以通过临床表现、胸部影像学鉴别,而且新型冠状病毒肺炎患者和疑似患者数量多,存在交叉感染或合并感染的风险,这种叠加效应易造成疫情继续蔓延和发展。

《关于印发新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行第六版)的通知》中特别指出:(一)新型冠状病毒感染轻型表现需与其它病毒引起的上呼吸道感染相鉴别;(二)新型冠状病毒肺炎主要与流感病毒、腺病毒、呼吸道合胞病毒等其他已知病毒性肺炎及肺炎支原体感染鉴别,尤其是对疑似病例要尽可能釆取包括快速抗原检测和多重PCR核酸检测等方法,对常见呼吸道病原体进行检测。当前阶段,尽早识别、鉴别新冠肺炎患者显得尤为关键。

● 赛默飞新型冠状病毒检测多靶标解决方案

赛默飞提供全面病原体检测解决方案,以及专业高效的技术支持服务。对本次突发疫情,赛默飞针对SARS-CoV-2迅速设计了检测试剂,目前该检测试剂已添加到呼吸道病原微流体芯片中。该微流体芯片结合了经典的TaqMan探针法和空间多重技术,一次同时对42种呼吸道感染相关病原进行核酸检测,为明确病原体种类、防止交叉感染、治疗方案的选择提供辅助信息。

呼吸道病原微流体芯片(覆盖新冠病毒SARS-CoV-2)

➤ 使用全球共享禽流感数据倡议组织(GISAID)收录的所有52个SARS-CoV-2完整基因,与目前NCBI收录的其他冠状病毒完整基因组(2116个)均无匹配。Assay包含针对新冠病毒三个靶标的探针:ORF1ab基因、N基因和S基因

➤ 广谱:可同时检测42种病原,包括30种病毒、11种细菌和一种真菌

➤快速:核酸分离后,2小时内获得结果

➤准确:秉承TaqMan 实时荧光定量PCR一贯的高灵敏度、高特异性及高精度的结果可靠性

➤简便:仅需5分钟手工操作

➤样本通量:可一次检测8个样本

➤多种平台选择:可搭载Applied Biosystems QuantStudio Dx、QuantStudio 7 Flex、Quant Studio 12k Flex等实时定量PCR系统

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