空间蛋白质组学:探索组织中隐藏的蛋白差异

2023-11-10 11:24:54, 莲莲看 北京青莲百奥生物科技有限公司


空间蛋白质组学研究蛋白质在细胞或组织中的空间分布和环境,揭示其定位、相互作用及功能关系,获取不同细胞和功能区域的蛋白表达谱。通过结合空间与细胞类型信息,深入了解组织微环境并发现生物标志物和新功能机制。与全组织分析相比,空间蛋白质组学可获得不同细胞和功能区域的蛋白表达谱;与单细胞分析相比,可获得空间位置特异性的蛋白表达信息。






青莲百奥解决方案


青莲百奥推出空间蛋白质组产品,利用HAMAMATSU切片扫描仪对切片进行扫描和注释,通过MMI CellCut Plus激光捕获显微切割 (Laser capture microdissection ,LCM)捕获新鲜冷冻样本或FFPE样本中感兴趣的区域,进一步使用微量/通用型蛋白质组试剂盒(MagicOmics-MMB)和Magicomics-AP-96全自动化前处理机器人进行高灵敏度的微量蛋白质组学样本前处理,采用Tims TOF HT 4D-DIA 质谱检测技术进行高通量的蛋白质组学检测,纳克级样本可实现毫克级检测深度,平均检出5000-8000个蛋白。





青莲百奥产品优势





高精度的切片注释

在常规空间蛋白质组依赖HE染色技术上,使用HAMAMATSU切片扫描仪对切片扫描和注释,结合其高分辨率、多通道扫描、自动化功能以及配套的图像处理和注释工具、方便和高效的数据存储和管理对不同类型细胞自动识别定位、特定类型细胞的单细胞级别筛选、组织微环境分布分析等。




高准确度精密切割

在常规LCM技术上进行优化,在MMI CellCut Plus激光捕获显微切割平台上实现基于HAMAMATSU切片扫描仪的注释信息实时成像观察,根据客户需求选定目标区域进行自动化动激光显微切割,可实现单细胞级别的切割。




自动化微量样品前处理

基于独创性纳米磁珠富集技术,青莲百奥微量/通用型蛋白质组试剂盒(MagicOmics-MMB)对中微量样品中的蛋白具有高效的富集能力,配套使用蛋白质组学全流程自动化前处理机器人(MagicOmics-AP-96),能够实现空间蛋白质组学样本处理全流程自动化,最多可同时处理96例样本,在大大降低实验周期的同时,能够保证蛋白质检测的准确性和稳定性。




高深度质谱检测

通过整理多种先进技术,再结合最新4D DIA tims TOF HT可实现高深度的蛋白组学检测,单个样本平均可检出5000-8000个蛋白。在保证高深度检测的同时,不同细胞类型的样品可显著性区分并特异性聚类。




项目文章

青莲百奥的空间蛋白质组学项目在国内外学术界引起了广泛关注。2022年7月,青莲百奥与中国医学科学院北京协和医院合作,在《Nature Communications》上共同发表了国内首篇关于空间蛋白质组学的研究论文“Spatially resolved proteomic map shows that extracellular matrix regulates epidermal growth”,为国内空间蛋白质组学的研究树立了新的标杆。





应用场景


空间蛋白质组学是一种新兴的技术,能够在组织和细胞水平上对蛋白质分子进行高分辨率的定位和检测。该技术具有广泛的应用前景,可用于研究微环境与疾病发展、肿瘤组织异质性、机制与药物靶点研究以及组织器官空间图谱构建等方面。

青莲百奥是一家专注于空间蛋白质组学研究的科技公司,旨在为全球的科研机构和企业提供最先进、最专业的空间蛋白质组学服务。欢迎大家前来咨询~






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