DDA数据依赖采集模式进行自动化、并行质谱成像和脂质结构鉴定

2023-06-02 12:30:21, Create 科瑞恩特(北京)科技有限公司




前言


组织中脂质空间分布可以用来区别细胞、组织和疾病类型,脂质组学在研究机体生理病理过程中有着重要作用。质谱成像技术(MSI)已广泛应用于脂质组学的研究,然而同时进行脂质鉴定与空间定位能够获取更为详尽的信息,缩短实验周期。目前MSI实验中观察到的脂质鉴定方法依赖于组织匀浆的LC-MS/MS分析,导致空间信息丢失,因此寻找一种自动化脂质结构鉴定并行质谱成像的方法至关重要。



摘要


荷兰马斯特里赫特大学 Shane Ellis团队于2018年在《Nature Methods》上发表了题为“Automated, parallel mass spectrometry imaging and structural identification of lipids”的文章,该文章中作者开发了一种基于质谱成像的脂质组学工作流程,该工作流程能够在高分辨质谱成像的同时自动获取脂质鉴定数据。



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图1 基于ALEX123数据库对脂质分子进行DDA成像与自动结构鉴定的实验工作流程


本研究中采用40μm空间分辨率对大鼠小脑中的脂质成分进行成像以及脂质鉴定。

如图1所示,在MSI实验中使用FTMS和IT-MS/MS交替采集模式,在第一个位置获得FTMS全扫描谱图(橙色MS1),水平移动20μm后获得数据依赖(IT-MS/MS)谱图(蓝色MS2),在整个组织表面重复此模式采集直至完整扫描。ALEX123数据库中包含超过43000种脂质分子种类以及相关加合物特异性碎片离子,通过ALEX123数据库,分别对FTMS与IT-MS/MS得到的数据进行脂质种类匹配,从而准确鉴定脂质分子以及其空间分布情况。





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图2 自动化结构鉴定DDA成像数据


通过该方法检测到165种不同的脂质成分,在IT-MS/MS中自动匹配了113种脂质分子,其中104个采用高分辨FT-MS/MS进行验证,并且对不同的脂质分子进行质谱成像分析。






综述


综上所述,通过这样的方法可以实现自动化、高通量、高分辨率MSI数据的获取以及脂质分子结构的鉴定。未来可以通过与更灵敏的MALDI-2技术(激光诱导后电离技术)或衍生化技术相结合,来提高脂质物质的检测,从而依靠DDA数据依赖型质谱成像方法获得信息丰富的组学分析。


透射式超高分辨质谱成像系统

科瑞恩特 

此项研究中所采用的MALDI ESI InjectorTM (Spectroglyph,LLC)是我们公司目前在大中华区独家代理的离子源,该MALDI离子源可同时搭载ESI离子源,既可用于传统LC-MS/MS实验,也可用于质谱成像检测,通过双离子漏斗接口实现离子源快速切换,无需拆卸,操作便捷,并且接口可以进一步升级为MALDI-2和t-MALDI检测,大大提高空间分辨率和检测灵敏度。


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