2023-05-30 20:41:10, 赛默飞生命科学 赛默飞世尔科技生命科学产品
刚入科研坑,大家都说实验是玄学,我不信。做了几年蛋白互作实验,我终于确定了,他们是对的!
明明照着师兄的protocol,我做出来的却是:
蛋白提取太「刺激」,抗原失活搞罢工,
抗体就像个「海王」,假阳性让人抓狂,
千辛万苦见「条带」,背景脏的像煤炭……
然而,直到看完下面这些实验细节、技术手册和视频教学,我才发现什么叫 too young。埋头苦做,不如看看前人总结的经验!
抗体条带来干扰,怎样才能屏蔽掉
抗体的重链大约55kD,轻链大约25kD,如果你的蛋白也在轻、重链的范围内,浓浓的抗体条带很容易掩盖掉靶蛋白。这是因为靶蛋白与IP抗体一起洗脱,WB的二抗不但识别了靶蛋白一抗,也识别了IP抗体。分析了原因,就可以针对性进行优化了:
不让IP抗体洗脱:采用交联剂将IP抗体固定在带有proteinA/G的 beads上,也可以将IP抗体直接与活化的beads交联,不需要使用protein A/G 作为IP抗体和beads 的桥梁。无论哪种方法,在洗脱过程中,IP抗体被牢牢固定在了beads,不会在下游的WB实验中出来捣乱了。
使用只识别天然构象的二抗,IP抗体与靶蛋白一起洗脱下来后,要经过电泳等一系列过程,其结构也早就受到了破坏,不付其天然模样了。此时如果选择只识别天然构象的二抗,IP抗体就不会被识别,也不会被检测出来了。
好物推荐
Pierce™ 交联法磁珠法 IP/Co-IP 试剂盒
一盒两用,非常灵活,足足可用40次!
使用试剂盒中单独提供的交联剂,可降低抗体干扰,适合实验优化;不使用交联剂,此试剂盒变身磁珠法经典IP/Co-IP试剂盒,适合实验室新手或者常规实验。
Pierce™ 免疫共沉淀试剂盒
直接交联抗体,不挑亚型,50次大规格!
Pierce 免疫共沉淀试剂盒经过优化,使用可直接且永久偶联IP 抗体的 AminoLink Plus 树脂替代蛋白 A/G 琼脂糖微珠,不挑抗体,且减少IP抗体是实验结果的影响。
实验准备很重要,试剂类型要选好
喜欢DIY,填料不可少。填料的基质是选琼脂糖,磁珠,还是磁性琼脂糖,或者其他材质?目标蛋白是抗体还是重组蛋白,丰度如何?填料的载量如何?能否重复使用?都是 需要提前充分考虑的。
好物推荐
Pierce™ 蛋白 A/G 磁珠
高载量,每mL干填料可结合550~850ug 兔IgG。低特异性,连接重组蛋白Protein A/G,兼具蛋白A和蛋白G的结合位点。
Pierce™ 高载量Ni-IMAC磁珠,EDTA兼容
针对His标签蛋白纯化。Ni-IMAC磁珠拥有高结合能力(每 mL 沉淀微珠含有高达 80 mg 蛋白),可以耐受用于抑制金属蛋白酶并稳定敏感细胞内蛋白的高 EDTA 和还原剂。
蛋白互作第一步:靶蛋白一定要“看住”
细胞裂解提取蛋白作为第一步尤为重要,IP/Co-IP所用的样本质量很大程度受制于裂解液。一个理想的细胞裂解液应达成以下效果:稳定天然蛋白构象、抑制酶活性、最大限度避免结合位点变性、从细胞或组织中最大程度地释放蛋白。
当IP靶蛋白可溶于去垢剂,且抗体可以识别天然蛋白时,采用非变性裂解液,如NP-40或Triton X-100;如需更为剧烈的裂解效果,可选择含离子型去垢剂的变性裂解液,如常见的RIPA缓冲液。
好物推荐
Pierce™ IP 裂解缓冲液
IP 裂解缓冲液是一种基于改良 RIPA 缓冲液配方(不含 SDS)的哺乳动物全细胞裂解试剂。这种中等强度裂解缓冲液可高效溶解细胞蛋白,但不会像一般 RIPA 缓冲液那样释放染色体组 DNA 或破坏蛋白复合物。
Halt™ 蛋白酶和磷酸酶抑制剂单次使用混合物 (100X)
Thermo Scientific™ Halt 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物,可对蛋白样品提供全面的保护。100x浓缩液,24个小包装,适合实验室一起使用,杜绝交叉污染风险。
520怎么能少了宠粉!
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