基于新算法的生信挖掘,助力发表单细胞高分文章!

2023-05-24 16:08:41, 猫头鹰教室


单细胞测序是指获取单个细胞遗传信息的测序技术,即对单个细胞水平上,对基因组或转录组进行提取扩增和高通量测序分析。该技术能够揭示但个细胞独有的基因结构和基因表达状态,包括结构变异、拷贝数变异、RNA表达水平等数据,使不同细胞类型得以精确区分,并有助于科学家在但细胞水平进行分子机制的研究。目前单细胞测序技术已广泛应用于生物学各个基础研究领域。其临床应用转化也已在多个领域开展了深入探索,包括肿瘤、生殖健康、免疫系统疾病、感染性疾病(微生物)等领域。
一直以来,单细胞测序发表文章都是大家发表高分文章的选择之一。近年来,单细胞测序的价格越来越低,数据也越来越多,这为大家数据分析提供了良好的数据基础。不管是自测的数据,还是公共数据库数据,大家都可以拿来进行分析,获得自己发文所需的素材。随着生信分析越来越卷,以往标准化的单细胞分析流程,已经难以支撑大家发表高分文章,故引入高端算法势在必行,这不仅可让咱们的研究更上一层楼,也可以做为大家申请基金申请的前期基础,提高申请的几率。
为了协助大家发表自己的高分文章,申请基金,我们邀请了郝洁老师团队,开设本次课程。

讲师介绍
 

郝洁,复且大学附属中山医院,研究员,上海交通大学医学院附属第九人民医院兼聘高级专家,英国帝国理工大学医学院荣誉研究员,上海市浦江人才。研究方向包括核单细胞组学数据深度挖掘,细胞发育轨迹分析,环境污染监测,磁共振波谱对儿童脑瘤的分析,机器学习,模式识别,数据挖掘,生物信息学,化学计量学,多变量统计学,和代谢组学分析,致力于用统计学的方法来综合分析各种”组学“技术产生的大数据信息,从而更好的了解生物系统的功能。研究项目 batman 软件首次实现了代谢组学核磁共振谱自动代谢物定性和定量分解,并且已经拥有 40 多家欧美高校和科研机构客户。此算法软件系统已经成为业界标杆,是欧洲委员会第 7 框架大型科研项目资助的COSMOS(协调代谢组学标准) 项目数据分析的唯一合作伙伴。以第一作者和通讯作者在Nature Protocols, Bioinformatics, Analytical Chemistry,Briefings in Bioinformatics, Frontiers of medicine,NMR in Biomedicine等国际知名期刊上发表多篇高水平学术论文,google scholar他引超2600次。一篇文章归入Clinical Medicine学术领域同一出版年最优秀前1%, 并被web of science标示为热点论文和高被引论文。已授权发明专利3项(第一发明人)。


课程内容和时间安排
注:1、实际授课过程中,老师可能会对课程顺序进行微调。
2、请学员自带电脑,mac或者windows系统的笔记本(请勿使用XP系统)。

3、电脑配置要求内存不小于8G(小了会很卡)

课程例图

问题说明

1、新算法大家都认可吗?
     新算法都是有权威文章支持的,课程复现的例文就是利用新算法发表的文章。
2、运用新算法可以发表多少分的文章?需要加湿实验吗?
     湿实验是需要的,文章写作过关,只需要做一些简单的验证实验就可以发表5+的文章。
3、课程相关的代码和软件会提供给大家吗,需要另收费吗?
     课程相关的代码和软件我们会免费提供给学员,费用是包含在报名费当中的。
4、没有R语言基础可以学吗?
     可以的,老师会带着大家一步一步用代码复现一篇例文,课程中遇到问题可以在提问时间进行提问,老师会进行解答
5、我课上没有完全掌握,课后复习怎么办?
     我们会随堂录制课程,课后2-3天整理好视频发给大家,供大家课后复习,课程相关问题我们提供长期答疑。

会议信息
时间:2023年617日-18日(周六、周日)
平台:腾讯会议(参会人员提前下载腾讯会议电脑客户端,并注册登录)
报名费(可开票):
6月9日前
6月10至16日
3400
3600
二人组团报名,每人可优惠100
三人组团报名,每人可优惠200
四人及以上组团报名,每人可优惠300
名联系
请联系猫头鹰班长(微信号:xzlky2015-training),加微信时请注明“姓名+报名咨询

 



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