揭秘医学大类组织|空间代谢组物质检出一览及切片攻略放送

2023-04-18 17:49:16, 质谱创新组学上海欧易生物医学科技有限公司

▲ 点击图片预约线上一作直播讲座

空间代谢组学(Spatial Metabolomics)结合了质谱成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)和代谢组学，利用离子源直接扫描生物样品成像，不仅可以鉴定成千上万种代谢物的结构和相对含量，还可以在同一张组织切片上同时分析大量代谢物的空间分布特征，为传统代谢组学分析提供了全新的可视化视角，实现对代谢物进行定性、定量、定位三个维度的深入分析。

本文核心内容：

空间代谢组学在切片过程中需要注意哪些事项？

空间代谢组学检测不同类型样本的物质检出情况如何？

首先，好的数据结果离不开前期的实验处理。对于空间代谢组学的数据来说，其中成败的关键一定离不开切片，线上的研究资料中很少详细对空间代谢组切片的关注，鹿明生物经过多年的空间代谢组学研究经验，梳理了部分切片攻略，接下来具体看看吧。

空间代谢组学

切片实验具体流程

step1. 样本核对

step2. 样本固定及安装

step3. 样本修片

step4. 确认切面

step5. 正式样本收集

step6. 切片检查核对

切片技巧和注意事项

问题现象	主要原因	解决方法
切片出现厚薄不均一	1. 部分刀面有一层薄冰，导致切面不在一个层面 2. 手轮转速不均匀 3. 切片安装未完全固定	1. 更换刀片 2. 保持均一速度进行切片 3. 检查刀片安装情况保证刀片前后出刃一致
切片中途突然出现切片厚度极巨增加	样本与固定底盘未链接紧，从底盘脱落	对样本及时补充胶进行二次固定
切片成片异常卷曲	1. 防卷板受损 2. 防卷板未伸出	1. 检查防卷板受损位置，调整样本位置避开破损处 2. 调整防卷板伸出长度
切片软化	1. 切片环境温度升高 2. 机舱内温度升高	1. 室内降温，检查舱门打开的时间 2. 降低机舱，及样本头温度

其次，准确的数据结果离不开数据库的贡献，目前鹿明生物形成了一套标准化的多维度建库流程，已经形成心、肝、脑、肾、肺、肿瘤等多种组织类型的空间代谢组专属数据库。

空间代谢组学在各类型组织中检出的物质大类占比

鹿明生物AFADESI空间代谢组学常测定出的脑组织代谢物主要包含有：5-羟色胺、乙酰胆碱、GABA、多巴胺、组氨、褪黑激素等，运用鹿明生物空间代谢组学数据库鉴定脑组织中大类物质的检出占比，如下图所示：

鹿明生物AFADESI空间代谢组学常测定出的肝脏组织中代谢物主要有ATP、正磷酸盐、D-葡萄糖、草酰琥珀酸盐等，运用鹿明生物空间代谢组学数据库鉴定肝脏组织中大类物质的检出占比，如下图所示：

鹿明生物AFADESI空间代谢组学常测定出的肾脏组织中代谢物主要有N-乙酰组胺、磷酸丝氨酸、肌苷、果糖基赖氨酸等，运用鹿明生物空间代谢组学数据库鉴定肾脏组织中大类物质的检出占比，如下图所示：

鹿明生物AFADESI空间代谢组学常测定出的肿瘤组织中代谢物主要有天冬氨酸、脯氨酸、次黄嘌呤、腺嘌呤等，运用鹿明生物空间代谢组学数据库鉴定中肿瘤组织中大类物质的检出占比，如下图所示：

鹿明生物AFADESI空间代谢组学常测定出的肺组织中代谢物主要有L-乳酸、D-葡糖糖、水杨酸、柠檬酸盐等，运用鹿明生物空间代谢组学数据库鉴定中肺组织中大类物质的检出占比，如下图所示：

鹿明生物AFADESI空间代谢组学常测定出的心脏组织中代谢物主要有D-葡糖糖、熊果苷、草酰琥珀酸盐、D-阿洛糖等，运用鹿明生物空间代谢组学数据库鉴定中心脏组织中大类物质的检出占比，如下图所示：

小鹿推荐

鹿明生物的AFADESI-MSI空间代谢组技术，受到AFADESI-MSI原创团队核心专家-贺玖明教授全力支持。自2021年1月1日起，已落地执行200+项目，已建立脑、心、肝、肺、肾、肿瘤组织等多种组织类型的空间代谢组自建数据库。AFADESI-MSI平台不涉及基质喷涂，定性到的物质中约30%为脂质类物质，约70%为700Da以下的小分子物质，可更均衡地涵盖1000Da以下的小分子物质。

鹿明生物也是国内最早开始同时进行空间转录组与空间代谢组的公司。现已获得多项实验检测、分析上的软著及专利。基于AFADESI平台发表的方法学及应用文章目前已在Gut、PNAS、Theranostics、Advanced Science、Analytical chemistry、Analytica Chimica Acta等期刊上发表相关文章10+篇。

本期内容就到这了，更多关于空间代谢组学的技术交流，欢迎大家在下方互动留言哦~

关注

鹿明生物提供优质的空间代谢组服务