用户视野 | timsTOF Pro 2助力复杂蛋白质组解析

2023-03-09 06:09:09, 4D-组学老虎队 布鲁克(北京)科技有限公司-质谱仪器


蛋白样高度复杂性一直是蛋白质组研究的难点之一。例如对大分子复合物和微量临床样本的分析,这些样品具有复杂的组成和较宽的动态范围,对质谱仪的扫描速度、灵敏度和分辨率提出了很高的要求。
视频专访: Max Planck多学科科学研究所的Henning Urlaub教授&哥廷根大学医学中心的Christof Lenz博士

Max Planck多学科科学研究所的Henning Urlaub教授课题组致力于基于质谱的蛋白质复合物研究,他们利用timsTOF Pro 2扫描速度快、灵敏度高的特点,可以发现更多蛋白与蛋白或核酸的相互作用,为解释蛋白质复合物功能和生命活动提供更多组学依据。

哥廷根大学医学中心的Christof Lenz博士表示,timsTOF Pro 2是在短时间梯度内实现蛋白质组深度覆盖的有力工具,而且其有着灵敏度高的特点,针对心血管疾病病人的微量活体组织样本,利用优化的 dia-PASEF®方法可在蛋白质组实验中实现无偏向性的蛋白深度覆盖和定量,为研究心血管疾病和相关疗法提供有力支持。

timsTOF Pro 2配备的捕集离子淌度质谱(TIMS)增加额外一维度的气相分离,可显著降低样品复杂度。基于双TIMS技术的平行累积连续碎裂技术( PASEF®)技术可达到>120Hz的扫描速度而不会损失灵敏度和分辨率,实现对低丰度肽段离子多次重复选择并碎裂,以提高低丰度肽段的二级谱图质量,使分析复杂蛋白样本成为可能。


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