多组学联合网络药理学研究疾病机制和药物机制 10月29-30日 周末

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第一天上午8:30-11:30

一、 转录组学联合网络药理学研究

转录组学联合网络药理学研究案例和思路

网络药理学概述

基于GEO数据库的差异基因分析

Cytoscape软件构建PPI网络（网络构建、节点和边的渲染、网络合并、核心网络的筛选等）

转录因子调控网络的构建

MicroRNA网络的构建

第一天下午2:00-5:00

二、 代谢组学联合网络药理学研究

代谢组学联合网络药理学研究案例和思路

代谢组学数据分析（Smica-p软件的使用方法、PCA分析、PLS-DA分析、OPLS-DA分析、相关性分析等）

基因-代谢物网络的构建（Metascape软件构建基因-代谢物网络）

第二天上午8:30-11:30

三、组学联合网络药理学分析方法

1. 网络拓扑结构分析

2. 网络聚类分析（MCODE、CytoCluster插件进行聚类分析）

3. 通路分析（ClueGO、Reactome进行通路富集分析、RStudio绘制通路富集气泡图）

4. 网络中节点排序方法（CytoHubba插件进行节点排序等）

5. 多组学整合分析

第二天下午2:00-5:00

6. 分子对接解析药物和靶点的结合模式（Audock Vina分子对接软件的使用，对接结果的可视化）

7. 基于Connectivity Map进行药物重定位

本次课程以研究案例结合实际操作展开，全程电脑实战教学。90%以上内容都会涉及到上机指导，无繁琐的理论授课，做到课程学完，就能独立解析疾病和药物的潜在分子机制，为后续的实验验证、基金申报提供指导。

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