2022-09-20 06:52:40, 小维 武汉迈特维尔生物科技有限公司
近3年来,在中药的研究中,网络药理学的研究应用越来越丰富,而随之而来也出现了很多问题极可能阻碍网络药理学的正常发展。
2021年,针对网络药理学的研究,由世界中医药学会联合会网络药理学专业委员会、清华大学主持制订了国际第一部《网络药理学评价方法指南》,该指南中对网络药理学的结果评价做出了详实的规定,而在这样一个规定下,网络药理学也会逐渐健康发展。
本期我们就一起来具体了解一下网络药理学以及网络药理学包括的内容,而后面我们则会以实际的数据来为大家展示具体如何进行操作。
网络药理学的历史
20世纪90年代
清华大学李梢教授
突破“单靶标”研究局限为“网络靶标”
1999年
中国科协首届学术年会
李梢教授提出假说“中医药和生物分子网络之间存在联系”
2002年
清华大学李梢教授
中药方剂的作用机制可能在于对复杂疾病的功能基因网络的影响,从而发挥“多因微效”的整体调节作用,由此“涌现”疗效
2007年1月
清华大学李梢教授
利用生物信息学方法首次构建出中医寒热证生物分子网络
2007年7月
中药方剂网络调节研究框架
2007年10月
英国药理学家Hopkins提出“网络药理学(network pharmacology)”一词
2008年3月
李梢教授课题组进一步研发了基于生物网络的致病基因高精度预测方法,随后发展了基于生物网络的药物组合协同作用确定方法,获中国、美国发明专利
2008年10月
Hopkins发表论文提出网络药理学是“下一代药物研发模式”,内容涵盖系统药理学、多向药理学等方面
网络药理学的研究现状
以关键词“网络药理学”在中国知网上进行检索,累计出现8331篇相关文献,而发表的时间也在近两年呈现出爆发式增长的趋势。其中与中药学和中医学的累计达到7890篇,占比达到94.5%。
网络药理学的研究模块
在《网络药理学评估方法指南》中,明确指出网络药理学的研究包含三个部分的内容:数据收集、网络分析、实验验证。
1.数据收集模块主要包括4个部分:
中药饮片/复方成分的收集可以通过两种方式:
中药代谢组学检测和数据库,数据库主要包括TCMSP、TCMID、TCM;
成分靶点收集主要通过数据库获取:
TCMSP(结合uniprot)、Swiss target Prediction;
疾病靶点收集主要通过数据库获取:
GeneCards、DisGeNET、OMIM;
靶点通路分析:
使用数据库Metascape、DAVID、KOBAS进行富集通路收集;
2.网络分析
通过CytoScape搭建中药-成分-靶点网络图;
通过STRING数据库进行蛋白质互作分析(PPI);
3.实验验证
文献验证
计算化学实验验证
酶/蛋白水平实验验证
细胞模型实验验证
动物模型实验验证
临床实验验证
每一个验证都是在较上一个验证更加深入,从目前的文献来看,较多的验证类型包含三个:酶/蛋白水平、细胞模型和动物模型。
网络药理学拟解决的科学问题
本期我们简单从不同的方面了解了一下网络药理学的内容,后面我们就来实际看下如何在现有的研究进展上进行一篇完整的网络药理学内容的研究。
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