TidyMass独家教学 | 基于R语言和TidyMass的代谢组学全流程数据分析

2022-09-14 23:42:40, Biotree 上海百趣生物医学科技有限公司


众所周知,利用组学技术进行研究时,数据的分析尤为重要。而在LC-MS数据分析中,可重复性、可追溯性和透明度(Reproducibility, traceability, and transparency)一直是LC-MS数据分析的长期存在的问题。虽然现在已经开发了多种工具,但是他们仍然存在着局限性。(关于TidyMass更多内容可点击查看往期推文哦:https://mp.weixin.qq.com/s/ja_Fl9axPLZYPqfTYA6mag

7月27日,Nature Communications日刊发布:TidyMass an object-oriented reproducible analysis framework for LC–MS data

面向对象的LC-MS数据可重复分析计算框架,来自斯坦福大学遗传系的研究成果。它成功解决LC-MS数据分析中可重复性、可追溯性和透明度的痛点,基于R语言的综合计算框架,可以实现LC-MS数据的可追溯、可共享和可重复的数据处理和分析工作流程。TidyMass是一个共享底层设计理念、语法和数据结构的R包生态系统,它提供了一个全面的、可重现的和面向对象的计算框架。模块化架构使TidyMass成为一个高度灵活和可扩展的工具,其他用户可以改进并与其他工具集成以定制自己的管道。

TidyMass现在主要支持LC-MS的非靶向代谢组学的数据分析,也支持一部分的蛋白质组学的数据分析。后续开发者将继续完善其用于蛋白质组学的全流程分析。

百趣生物联合此论文的两位一作,斯坦福大学申小涛博士后与耶鲁大学闫红博士后,将开展为期5天的线上培训班。带领大家从质谱代谢组学数据基础入手,一站式进行物质的定性定量,数据分析,数据清洗,预处理,常规统计建模以及通路分析。

此次培训班课程由申小涛博士后和闫红博士后全程指导教学,带大家深入了解代谢组学在疾病和其他领域的应用前景,掌握R语言和TidyMass全流程的代谢组学数据分析和相关功能应用,对代谢组学的数据结构,数据分析和生物学意义,代谢物数据库的建立和代谢物鉴定有更深入的了解。

讲师介绍

申小涛  博士后

斯坦福大学医学院,主要研究方向为质谱数据生信软件开发,多组学数据整合分析及其在精准医学上的应用。

闫红 博士后

耶鲁大学医学院与公共卫生学院,主要研究方向:质谱数据分析的方法;结直肠癌的代谢组学研究及其多组学分析;KRAS变异在结直肠癌中的性别差异;铁死亡在结直肠癌中的代谢机制;机器学习在癌症多组学分析中的应用。

课程详情

优惠福利

1

早鸟福利:于9月16日前购买该课程,原价2199元现享早鸟优惠价1999元/人

2

团购优惠:5人成团每人立减200元

该活动优惠可叠加使用!可叠加使用!即16号前团购满5人该课程价格可低至1799元!

注:本次活动以到款时间计算优惠!

报名方式

1

和BIOTREE全国各地的销售工程师直接联系报名。

2

致电400-664-9912直接报名,期待您的来电!

3

在此微信公众号后台留言“姓名+单位+电话+邮箱+课程”,我们将尽快与您取得联系。

4

发送邮件至marketing@biotree.cn,我们会尽快与您电话取得联系。邮件标题“TidyMass线上课程”正文包含报名课程名称及时间、姓名、电话及单位名称。

5

扫描下方二维码填写报名表预留席位。


1

注:
1.本次培训班实行人满开班制哦~报名满50人开班,100人满员截止!请有意参加课程的老师及时联系我们进行报名注册!
2.报名成功后以到款时间计算优惠,不参与优惠报名的老师也需在9月21日前付款到账,为您保留名额哦~

报名常见Q&A

Q

基础薄弱适合学习这门课程吗?

A:课程设计是带领大家从质谱代谢组学数据基础入手,一站式进行物质的定性定量,数据分析,数据清洗,预处理,常规统计建模以及通路分析。只要认真上课问题不大哦~

Q

线上在上课途中遇到问题怎么办?

A:全程设置微信群答疑,讲师亲自解答。讲课结束后亦可与讲师开麦交流。

Q

上课没跟上,还能提供复习吗?

A:当日课程结束后下午即提供视频课程回放,随时回顾,巩固知识点。再也不怕忘记内容了。

Q

对电脑配置有什么要求吗?

A:8G以上运行内存皆可~

文献下载链接:

https://pan.baidu.com/s/1kLYM7Jkw6hV1PQSPjm9meQ

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百趣生物

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