肿瘤免疫微环境和免疫浸润分析生信实操课1.22-1.23

近期“肿瘤微环境、免疫浸润分析”相关研究不仅在论文发表上，发表数量逐年递增。从近年的国家自然科学基金资助的项目数和总金额来看，肿瘤微环境和免疫方向相关立项也是节节攀升，反映了这一研究领域的重要性。

肿瘤微环境主要由肿瘤细胞、成纤维细胞、免疫细胞、各种信号分子和细胞外基质及特殊的理化特征等共同组成，肿瘤微环境显著影响着肿瘤的诊断、生存结局和临床治疗敏感性。

通过发挥促肿瘤作用和抗肿瘤作用，浸润肿瘤的免疫细胞可以深刻影响肿瘤的进展以及抗癌治疗的成功。因此，肿瘤浸润免疫细胞的量化有望揭示免疫系统在人类癌症中的多方面作用，并参与肿瘤逃逸机制和对治疗的反应。

因此免疫浸润也是近几年肿瘤研究的一个重要方向。目前也有一些比较方便的工具帮助大家挖掘免疫浸润，如CIBERSORT等。

那么到底热门文献中免疫浸润分析是什么样的？我们自己能不能做得出来？免疫浸润分析的相关工具和数据库到底有哪些，又该如何使用？

《手把手教学公共数据库生信挖掘实操精讲班》将带领大家逐一对相关的工具和数据库进行学习，希望大家学习之后对免疫浸润分析有更深刻的了解，基本能够满足论文和基金中对于免疫浸润分析的需求。

1、主流免疫浸润分析数据库（IMMUPORT、TISIDB、TIMER等）的熟悉掌握。

2、主流免疫浸润分析工具（CIBERSORT、ESTIMATE、xCELL等）的熟悉掌握。

3、掌握复现高分文献中免疫浸润相关展示图表的能力。

4、能够满足日常文章以及国自然基金免疫浸润分析相关图表的制作。

宋老师，从事生信分析工作多年，参与并完成了超过百个软件著作权和发明专利的撰写和申请，参与超过近三百个项目的设计、开发、分析环节。

研究方向：擅长GEO、TCGA数据挖掘；转录组、代谢组，蛋白组，16S等二代测序标准分析和定制化高级分析；长期专注于肿瘤方向生物信息数据分析，精通R语言以及各类生物信息学软件。

主要培训方向：《GEO数据挖掘》、《TCGA数据库挖掘和应用》、《网络药理学分析》、《肠道微生物相关分析》等