1秒提取化学结构!省100倍时间的化学绘图神器重磅来袭!

2021-11-30 09:30:16, 苯宝宝装醇


化学领域“画结构式”这件事情,会耗费我们大量的工作时间,而且很容易画错。ChemDraw凭借强大绘图功能已成为化学人首选结构绘制软件,然而人类的本质是“懒惰”,AI技术的高速发展使一个图片式的化学结构or一个化学名称,瞬间转变为一个可编辑、多重方式输出的可用结构成为实现。利用AI软件不仅能上百倍节省我们绘制化学结构时间,还能提升专业技能。
前几天实验室Boss推荐给我们这款极速提取化学结构软件StoneMIND Collector】(下文简称Collector),在深度使用两周之后,感觉Collector真的是太好用了,而且还免费!!不敢独享,特分享给大家。下载方式请查看文末链接。


推荐等级:★ ★ ★ ★ ★ 


使用方便+高准确度识别各类化学结构

选中任意文件中的化学结构后截图,短短1秒就可以识别成计算机可编辑格式的结构文件。例如我们看到某篇专利或者文献中想摘录下来变成可编辑的化学结构,用Collector一键截图即可省去繁琐易出错的绘制过程!以摘抄下方这个结构相对复杂的天然产物为例,如复制到PubChem数据库的搜索框中,来获得该分子的理化性质、生物活性等信息;识别准确度很不错,瞬间给出清晰漂亮的化学结构,超赞~
Collector可将识别的分子结构一键复制为SMILES/MOL格式,如复制到PubChem数据库的搜索框中,来获得该分子的理化性质、生物活性等信息;也可直接下载分子结构为SDF格式,方便之后的使用。




批量提取2000个结构仅需30分钟!


面对有许多化学结构需要识别的情况,一次性识别多个结构是非常有必要的使用Collector网页版来进行专利或文献中化学结构的批量提取,只需上传.pdf文件格式或.jpg、.png图片格式文件即可批量提取,专利的批量提取也可直接输入专利号检索提取,提取方法包括支持OCSR(化学结构识别) IUPAC(标准化学名称识别)两种技术。目前Collector批量提取任务(1个任务对应1个pdf/jpg/png格式的文件)提交后后台会自动提取,待任务结束再查看和下载提取结构即可。


其他超赞功能

在实际的应用中,化学结构的识别往往只是一个开始,思考和发展有利于后续科学研究的功能十分必要。如对于药物设计学家来说,化学分子的理化性质分析及结构的优化功能或许很有用。当然,抛去核心需求的功能更多的是锦上添花,作为化学结构提取的软件,首先应该保证的是快捷性和准确性。笔者看过一些对比数据文章,Collector识别准确度在同类型产品中已处于领先水平,强烈推荐大家使用。
Collector在完成图片抓取后,通过“收藏”选项,可以将结构进行历史保存。重点来了!!!通过打开左侧工具栏的“收藏夹”,会跳转到网页,宝藏出现!!!。



潜在宝藏&分子信息预测


通过上面的界面,大家可以一目了然的看到所谓的“宝藏”,即分子信息的预测且不仅仅局限于上图中的“类药性、可合成性、溶解度、LogP、hERG”,将收藏的结构进一步点击打开,还会有更为详细的分子信息预测。具体如结构性质方面的类药性、可合成性、氢键受体数目、氢键供体数目、极性分子表面积;理化性质方面的溶解度、logP;DMPK性质方面的Caco-2肠渗透性、生物利用度、血浆蛋白结合率、血脑屏蔽穿透率、PGP底物、CYP450抑制;毒性方面的hERG,等等。这些信息的反馈,对于药学领域研究人员来说,极为珍贵!对于结构的理解,帮助极大!



StoneMIND Collector给出的分子结构预测


综上,就是这个软件当前的使用体验,话不多说,现总结如下:


✔ 免费

✔ 安装方便,格式较小,兼容性好

✔ 界面简单友好

✔ 图片结构识别快速

✔ 可进行IUPAC(标准化学名称)识别

✔ 抓取的结构可进行编辑

✔ 可输出sdf/mol/smiles格式文件

✔ 收藏+历史记录

✔ 分子特性预测

✔ 多结构同时抓取


Windows & Mac版软件获取方式


Collector由国内AI制药公司北京望石智慧科技有限公司开发,以下信息从官方摘抄


下载地址(复制至PC端浏览器打开,点击下载客户端即可)

https://stonewise.cn/mol_product?channel=9


注意:部分用户可能会遇到软件包的下载安装操作被自动拦截,这受限于您的电脑安全设置策略,请手动允许其下载和安装,该软件安全无毒,请放心使用。


温馨提示


1.在Collector客户端点击左侧导航栏图标,即可观看产品使用视频。

2.打开望石智慧官网www.stonewise.cn,点击产品介绍下的StoneMIND Collector, 有该产品的详细介绍和使用视频。

3.任何产品使用问题或建议可直接联系Collector微信客服,请扫下方二维码添加微信或工作日9:00-18:00拨打手机号15711471378(微信同号)。



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