2021-11-17 17:58:28, 共同抗疫的 深圳华大智造科技有限公司
10月中旬以来,新一轮疫情再度来袭,全国多地出现了疫情反弹和零星病例,由于传播速度快且处于北京冬奥会即将来临之际,各级政府高度关注,疫情防控工作再次进入紧张状态。华大智造测序平台也积极投身疫情防控工作中,成功助力多地监测病毒变异工作。
11月6日,在呼和浩特市新冠肺炎疫情防控工作新闻发布会中,官方表示,呼和浩特市已于10月27日完成本次疫情3个确诊病例样本的病毒基因测序,结果显示,本次新冠肺炎确诊病例为21A—德尔塔毒株。
本轮疫情发生以来,呼和浩特市共报告3例本土新冠肺炎确诊病例、1例疑似病例。10月31日,对报告疑似病例予以排除;11月4日,1例确诊病例治愈出院。现有2例本土确诊病例,在内蒙古自治区第四医院接受治疗,病情平稳。
华大智造MGISEQ-2000高通量基因测序仪
在本轮疫情防控中,呼和浩特市疾控中心使用了华大智造MGISEQ-2000高通量基因测序仪。作为一款高准确率、低成本的全能型桌面测序仪,其高效灵活的特性为呼和浩特市疫情实现快速溯源和防控提供了有力支撑。
10月24日,在四川省自贡市疾控中心实验室,微生物检验所王斌副所长一边操作设备,一边通过显示器展示由碱基组成的全基因序列,“这个碱基序列就是新冠病毒的碱基序列——也是此次我市富顺确诊病例病毒的‘原形’,将其与数据库中的其他新冠病毒碱基序列比对,就能分析出该病毒与哪里的病毒同源、是否发生了变异……”
在华大智造测序平台的支持下,自贡疾控实验室继荣县复阳患者后,再一次成功检测出富顺县确诊病例“德尔塔”突变株。这标志着自贡市成为除四川省疾控、成都疾控外,省内能独立通过新冠病毒基因测序进行病毒溯源的地市级疾控中心。
华大智造MGISP-100高通量自动化样本制备系统
据了解,在10月23日晚,自贡市富顺发生一例输入性可疑新冠阳性病例后,中心李群主任第一时间作出指示,出动现场应急检测车、调派核酸检测实验室人员赶赴富顺,开展疫情现场检测及复核工作,最终在凌晨确定了该病例为新冠核酸阳性无症状感染者。同时立即启动了测序工作,25日凌晨1点测序结果分析为德尔塔(Delta)毒株,与省疾控中心测序结果一致,经中国疾控中心比对分析,自贡市感染者基因组完整度高(96.8%),为“德尔塔”突变株,与内蒙古额济纳旗疫情关联其他病例毒株高度同源,成功溯源为疫情处置提供了精准的科学依据。
近期,在阿拉善盟疾控中心生物安全二级实验室,专业技术人员在华大智造工程师的指导下,开展了第一例新冠肺炎病例阳性标本基因测序工作,经过多日实验,测序结果为德尔塔变异株。此次阿盟疾控中心生物安全二级实验室启用华大智造高通量测序技术,为阿左旗和额济纳旗新型冠状病毒疫情病原体的鉴定和溯源,以及对疫情防控工作等提供了强大的技术支撑。下一步,阿盟疾控中心将对额济纳旗新冠肺炎病例和环境阳性标本进行测序工作。
截止到11月8日12点,共完成122例新冠样品的溯源工作,详实且一致的测序结果再次支持了本轮阿拉善相关疫情的源头来自于中蒙边界策克口岸这一科学论断。
病毒基因测序能在第一时间获取病毒的基因组序列信息,已成为研究疾病暴发、追踪病毒变异的重要工具。通过检测新冠病毒的全基因组序列,再将这个序列通过软件分析与数据库中的序列进行比对,可以准确地判断其地域来源及这些病例是否来自同一传播链或传染源。
基因测序需要经过核酸提取、目的基因的捕获、扩增、纯化、建库等步骤,这些看似简单的流程,却需要十分精细的操作和计算。从新冠病毒爆发以来,在抗击新冠疫情的战场上,先进的病毒基因测序技术一直冲在最前线,为疫情防控提供了重要的工具支撑。
华大智造作为全球范围内少数几家具有自主研发能力并量产临床级测序仪的制造商之一,自疫情发生以来,一直依托其测序平台对病毒进行基因测序,先后为厦门、瑞丽、海口、济南、石家庄等近百家疾控中心和相关机构提供工具支撑,为其疫情防控工作提供有效依据,全面助力各地新冠病毒鉴定与溯源工作。
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