质谱流式文献精选（11）

2021-11-11 04:58:18, FLUIDIGM

近日，CHU et Faculté deMédecine的Raphael Carapito研究团队在《ScienceTranslational Medicine》发表研究成果，结合全基因组测序，全血样本RNA测序，质谱流式技术及shotgun蛋白质组学技术，分析血浆及PBMC的细胞因子和免疫表型，对原本年轻健康的新冠重症患者、非重症患者及健康对照组进行了多组学研究。研究结果揭示了一种独特的免疫相关基因标记，可以区分没有明显共病的重症和非重症患者。

参考文献：

Carapito R, Li R,Helms J, et al. Identification of driver genes for critical forms of COVID-19 in a deeply phenotyped young patient cohort[J]. Science Translational Medicine, 2021: eabj7521.

免疫系统会通过迅速改变激活状态及细胞招募，触发T细胞分化调控以应对急性感染。

近日，加州大学旧金山分校的研究者们绘制出了单核细胞增生性李斯特菌急性感染完全免疫反应的细胞动力学图谱，并揭示了一种新的T细胞分化调控机制。

该小组使用包含41个marker的panel，应用Fluidigm质谱流式技术，对超过432万个单细胞进行免疫分型，以量化免疫细胞的比例及激活状态，这些标记板旨在识别所有成熟的免疫谱系，以及指定抗原提呈细胞和T细胞激活状态的几个标记。该panel被设计用于描绘所有成熟的免疫谱系，并识别出几个指定抗原提呈细胞和T细胞激活状态的marker。

参考文献：

Hiam-Galvez K J, Debarge R, Lareau C A, et al. Transient dendritic cell activation diversifies the T cell response to acute infection[J]. bioRxiv, 2021.

Turku大学的研究团队结合应用单细胞及蛋白质组学技术，对研究白色脂肪组织中的脂肪组织巨噬细胞的发展和功能进行研究，以寻找肥胖症与慢性炎症及代谢健康受损之间的关联。

研究者通过全面无偏差的质谱流式及遗传谱系跟踪模型对巨噬细胞亚群表型、发育起源和的功能进行了表征。数据表明，遗传及外部环境均可对巨噬细胞功能起到调控作用。同时，高脂肪饮食导致的特定巨噬细胞浸润可通过饮食干预逆转这一观察结果也印证了研究结论。

这一研究结果为使用不同marker进行特定细胞类型的鉴定提供了可供参考的方法，并提示巨噬细胞的遗传性对于其在白色脂肪组织中的功能调控方面发挥关键作用。

参考文献：

Félix I, Jokela H,Karhula J, et al. Single-Cell Proteomics Reveals the Defined Heterogeneity of Resident Macrophages in White Adipose Tissue[J]. Frontiers in Immunology, 2021:2995.

SARS-CoV-2感染可诱导血小板活化，增加血栓形成倾向，从而导致血凝块形成，提高了心血管疾病发生的风险。慕尼黑工业大学的研究团队提出，病毒刺突蛋白S(即使在没有病毒的情况下也与血栓形成有关)作为疫苗的一部分，是否会影响血液凝血活动。研究团队应用Fluidigm质谱流式技术，首次对接受BNT162b2疫苗接种的健康人类受试者的血小板表型进行表征。对跨膜受体、粘附蛋白和血小板激活标记物表达的分析表明，给药后血小板的反应性没有改变。

参考文献：

Klug M, Lazareva O,Kirmes K, et al. Platelet Surface Protein Expression and Reactivity upon TRAP Stimulation after BNT162b2 Vaccination[J]. Thrombosis and Haemostasis, 2021.

NK细胞通常在急性病毒感染时被激活，通过识别和杀死被病毒感染的细胞，从而建立免疫系统的第一道防线。为了更深入了解寨卡病毒急性感染期的NK细胞功能，The Centre d''Immunologie et des Maladies Infectieuses的Christopher Maucourant和Vincent Vieillard领导的研究团队，应用Fluidigm质谱流式技术对一组女性感染者的NK细胞受体-配体库进行分析。研究结果表明，NK细胞对有效的适应性抗病毒免疫应答起积极作用，并可能因此会影响疾病的结果或持续症状的发展。

参考文献：

Maucourant C,Queiroz G A N, Corneau A, et al. NK Cell Responses in Zika Virus Infection AreBiased towards Cytokine-Mediated Effector Functions[J]. The Journal ofImmunology, 2021, 207(5): 1333-1343.

由于诊断和治疗有限，我们对子宫内膜异位症的病理生理学仍知之甚少。近日，Yuliana Tan、Elise T. Courtois等人领导的研究团队，结合scRNA-seq和成像质谱流式技术，从单细胞水平对子宫内膜和子宫内膜异位症病变的转录组进行分析，并研究了治疗期间可能发生的变化。

通过结合使用scRNA-seq及成像质谱流式技术，这项全新的研究首次展现了子宫内膜异位症的全面细胞图谱及疾病微环境的整体视图。多种细胞类型的空间定位和识别有助于发现子宫内膜异位症中明细的细胞变化，以及免疫调节巨噬细胞、免疫耐受树突状细胞和子宫内膜异位症特有的血管变化。

参考文献：

Tan Y, Flynn W F, Sivajothi S, et al. Single cell analysis of endometriosis reveals a coordinated transcriptional program driving immunotolerance and angiogenesis across eutopic and ectopic tissues[J]. bioRxiv, 2021.

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