8分以上高分文章!科研大佬都是怎样设计研究思路的?

2021-11-10 19:50:55, Winnie 上海吉凯基因医学科技股份有限公司


2021年1-10月,吉凯基因客户硕果累累,已发表科研成果3200+(数据来源于谷歌学术),10分以上文章120+。本期,小编将继续给大家分享10月新鲜出炉的高分文章,涉及肿瘤、神经、代谢等多个领域,让我们看下科研大佬都是怎么样设计研究思路的吧。

肿 瘤

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Elevated expression of nuclear receptor-binding SET domain 3 promotes pancreatic cancer cell growth.


发表期刊:Cell Death & Disease.    IF= 8.469

发表单位:苏州大学第二附属医院/江苏大学附属昆山医院

吉凯助力:NSD3 干扰AAV9;NSD3 干扰慢病毒和过表达慢病毒(T1232A和pY1174A突变型),感染胰腺癌细胞。NSD3 CRISPR/Cas9 KO慢病毒,感染人原代胰腺癌细胞,制备单克隆细胞。


CRISPR/Cas9系统依赖的NSD3 KO 在胰腺癌细胞中发挥肿瘤抑制功能


文章摘要:核受体结合 SET 域 3 (NSD3) 催化赖氨酸 36 (H3K36) 处组蛋白 H3 的甲基化,并促进癌症恶性转化和进展。本文将研究其在胰腺癌中的表达、潜在功能和机制。生物信息学结果表明,在人胰腺癌组织中,NSD3 表达上调,这与较差的总体生存率相关。细胞功能学实验结果显示:NSD3 沉默或 CRISPR/Cas9 诱导的 NSD3 敲除可有效抑制胰腺癌细胞的增殖、迁移和侵袭,同时引发细胞周期停滞和细胞凋亡。相反,NSD3-T1232A 突变型的表达显著加速胰腺癌细胞的增殖、迁移和侵袭。此外,NSD3 沉默或敲除还导致了H3K36二甲基化,Prkaa2、Myc、Irgm1、Adam12 和 Notch等基因的表达水平降低,并抑制了mTOR 的激活。体内实验结果显示,瘤内注射AAV-NSD3 shRNA 有效抑制了裸鼠胰腺癌异种移植物的生长。这些结果表明,升高的 NSD3 可能是胰腺癌恶性进展的重要驱动因素。

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Identification of histone methyltransferase NSD2 as an important oncogenic gene in colorectal cancer.


发表期刊:Cell Death & Disease.    IF= 8.469

发表单位:温州医科大学第一附属医院/苏州大学第二附属医院/盐城市第一人民医院/江苏大学附属昆山医院

吉凯助力:NSD2干扰慢病毒、NSD2 干扰AAV9、NSD2 CRISPR/Cas9 KO慢病毒(感结肠癌细胞,MOI 8)、NSD2突变型慢病毒 (Y1179A, NSD2-Mut)


AAV-NSD2 shRNA 注射后导致裸鼠 pri-Can-1 异种移植物的生长被抑制


文章摘要:结直肠癌 (CRC) 是癌症中导致人类死亡的第二大常见原因。组蛋白 3 (H3) 甲基化的失调可导致多个癌基因的转录激活,这与 CRC 肿瘤发生和进展密切相关。NSD2 是一种关键的组蛋白甲基转移酶,可催化组蛋白 H3 赖氨酸 36 二甲基化 (H3K36me2),本文主要研究其在 CRC 中的表达、潜在功能和分子机制。基因表达谱交互分析 (GEPIA) 生物信息学结果显示:在结肠癌和直肠癌中,NSD2 mRNA 表达均升高,此外,局部结肠癌组织中NSD2 mRNA和蛋白质表达水平显着高于周围正常组织。细胞功能学实验结果显示:在人原代结肠癌细胞和CRC 细胞系中,NSD2敲减或 CRISPR/Cas9 诱导的 NSD2 敲除抑制了细胞活力、增殖、细胞周期进程、迁移和侵袭、线粒体去极化、DNA 损伤和细胞凋亡。相反,NSD2 过表达则增强了细胞增殖、迁移和侵袭。在原代结肠癌细胞中,NSD2 沉默或敲除还导致了H3K36me2和多种致癌基因(如ADAM9、EGFR、Sox2、Bcl-2、SYK 和 MET)的表达和 Akt 激活显着降低,而NSD2 过表达则相反。体内实验结果显示,瘤内注射AAV-NSD2 shRNA可抑制裸鼠中原代结肠癌肿瘤的生长。总之,NSD2 在 CRC 中发挥致癌功能,可能是一个CRC的治疗靶点。

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神 经

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Deficient immunoproteasome assembly drives gain of α-synuclein pathology in Parkinson''s disease.


发表期刊:Redox Biology.    IF=11.799

发表单位:青岛大学

吉凯助力:NRF2和POMP干扰质粒


免疫蛋白酶体在α-Syn 病理学和神经变性中的机制


文章摘要:由蛋白酶体功能障碍引起的 α-突触核蛋白 (α-Syn) 异常积累被认为是引发和加重帕金森病 (PD) 神经变性的重要因素。尽管 26S 蛋白酶体参与蛋白质稳态失衡已被广泛接受,但其对免疫蛋白酶体功能的调节及在 α-Syn 病理学中的潜在作用仍了解有限。免疫蛋白酶体丰度和蛋白水解活性取决于组装过程,尤其是由POMP 介导的 β 环形成。本文,研究者发现 α-Syn 过表达与免疫蛋白酶体功能的降低有关,这反过来又限制了PLK2的降解,加剧了 α-Syn Ser129 的磷酸化和聚集,最终导致了神经变性。β5i 过表达可显著减弱这些影响。从机制上讲,α-Syn 抑制了NRF2 对 POMP 的转录调控,从而阻止了免疫蛋白酶体 β 亚基的组装。NRF2-POMP 通路在多巴胺能神经元上的特异性过表达,有效地挽救了 α-Syn 和 PD 样表型的聚集。这些发现将异常免疫蛋白酶体组装表征为控制 α-Syn 积累和神经变性的关键因素,可能为免疫蛋白酶体在 PD 中的意义开辟新的视角,并为治疗目的操纵免疫蛋白酶体组装提供方法。

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Microneedle-mediated vascular endothelial growth factor delivery promotes angiogenesis and functional recovery after stroke.


发表期刊:Journal of Controlled Release.    IF= 9.776

发表单位:四川大学/四川大学华西医院

吉凯助力:AAV-blank, AAV-VEGF,AAV-GFP


MN介导的VEGF过表达AAV转染治疗缺血性中风的示意图


文章摘要:缺血性中风仍是全世界致残的主要原因。尽管血管内皮生长因子 (VEGF) 能够促进血管生成和功能恢复,但其使用会受到以下原因限制,如针头导致的损伤、VEGF分布不均匀及颅内或静脉注射后脑内 VEGF 有限保留。本文,研究者首先提出了一种基于明胶甲基丙烯酰 (GelMA) 微针 (MN) 的平台,可将AAV-VEGF持续和可控地局部递送,实现在缺血大脑中VEGF的均匀分布和高效转染。在成年大鼠中建立缺血性脑卒中模型,在缺血发生一天后,将载有 AAV-VEGF 的微针插入缺血核心和半暗带,1周后,通过ELISA和免疫荧光评估炎症反应和微针生物相容性。8周后,评估血管生成和神经干细胞增殖和迁移。结果发现,微针植入没有引起明显的炎症反应,在大脑中具有良好的生物相容性。术后3周,载有 AAV-GFP 的 MNs 成功转染并在大脑皮层中均匀分布,装载 AAV-VEGF 的 MNs 增加了 VEGF 表达并增强了功能性血管生成和神经发生。总之,MNs 可能成为治疗缺血性中风和修复其他神经病变组织的有效平台。

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3

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Pyruvate kinase isoform M2 impairs cognition in systemic lupus erythematosus by promoting microglial synaptic pruning via the β-catenin signaling pathway.


发表期刊:Journal of Neuroinflammation. IF= 8.322

发表单位:南京大学

吉凯助力:PKM2 干扰AAV9,IBA-1小胶质细胞特异性启动子。用于MRL/lpr小鼠侧脑室注射,注射体积4 µL ,总量5E+10 vg,注射速率500 nL/min,注射后针头停留5min。


小胶质细胞 PKM2 抑制可减轻 MRL/lpr 小鼠的脑损伤和认知障碍


文章摘要:神经精神性红斑狼疮(NPSLE)是一种严重的并发症,可损伤大脑认知功能。本文作者主要研究小胶质细胞在 NPSLE 小鼠认知功能障碍中的作用。使用MRL/MpJ-Fas lpr(MRL/lpr)雌性小鼠作为NPSLE小鼠模型,代谢组学结果发现MRL/lpr 狼疮小鼠海马中的糖酵解升高,同时伴随着葡萄糖消耗和乳酸增加。此外,在狼疮小鼠中观察到海马小胶质细胞中 PKM2 被激活。细胞实验表明,PKM2 通过 β-catenin 信号通路促进小胶质细胞活化和过度激活小胶质细胞吞噬作用。体内,通过使用AAV9-IBA-1 promoter-shPKM2 注射小鼠脑室阻断 β-连环蛋白信号通路,结果显示小胶质细胞活化减少和神经元突触损失减少。抑制小胶质细胞 PKM2 后,MRL/lpr 小鼠的认知障碍和脑损伤得到显着缓解。这些数据表明小胶质细胞 PKM2 可能是治疗狼疮性脑病的新靶点。

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4

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MicroRNA-204-5p reduction in rat hippocampus contributes to stress-induced pathology via targeting RGS12 signaling pathway.


发表期刊:Journal of Neuroinflammation.   IF= 8.322

发表单位:山东大学

吉凯助力:miR-204-5p过表达AAV9。用于大鼠海马DG区注射,病毒工作滴度~1012 infection units/ml, 注射速率140 nl/min。


miR-204-5p通过RGS12/Nrf2-NF-κB通路抑制海马DG区氧化应激的发生


文章摘要:神经炎症在大多数神经系统疾病的发病机制中有重要的地位,而与抑郁症神经元损伤相关的神经炎症的潜在机制仍未清楚。慢性不可预测应激(CUS)用于诱导大鼠抑郁样行为。RNA测序用于检测差异表达的microRNA,结果显示慢性意外应激 (CUS)导致了大鼠海马齿状回 (DG) 区 miR-204-5p 的表达显著下调,并伴有氧化应激诱导神经元损伤。体内功能学和机制结果显示,CUS 大鼠 DG 区 miR-204-5p 的过表达通过直接靶向 RGS12的调节因子来减轻氧化应激和神经炎症,改善了CUS 大鼠的抑郁样行为。而miR-204-5p 的下调则诱导了DG 区的神经元退化和大鼠的抑郁样行为。总之,miR-204-5p 在抑郁表型相关的氧化应激机制中起关键作用。

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代 谢

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Sparcl1 promotes nonalcoholic steatohepatitis progression in mice through upregulation of CCL2.


发表期刊:Journal of Clinical Investigation.    IF= 14.808

发表单位:复旦大学附属中山医院/温州医科大学附属第一医院

吉凯助力:Sparcl1干扰AAV8(TBG启动子)。双侧注入小鼠腹股沟脂肪垫,注射量5E+10 pfu。


敲减腹股沟白色脂肪组织中的 Sparcl1 可改善小鼠NASH发病机制


文章摘要:非酒精性脂肪性肝病 (NAFLD) 代表了一系列慢性肝病,范围从单纯性脂肪变性 (NAFL) 到非酒精性脂肪性肝炎(NASH),而NASH 进展的分子机制仍未完全了解。白色脂肪组织 (WAT) 是重要的内分泌器官,不仅有助于 NAFLD 的初始阶段,还有助于其严重程度。本文中,研究者通过转录组学分析发现,NASH 小鼠白色脂肪组织和血浆中的Sparcl1表达上升,并与 NASH 患者的肝脏病理特征呈正相关。功能研究表明,慢性注射重组 Sparcl1 蛋白和过表达Sparcl1都会加剧小鼠的肝脏炎症和肝损伤。相反,敲低Sparcl1 及用 Sparcl1 中和抗体治疗可显着减轻由饮食诱导的 NASH 发病机制。从机制上讲,Sparcl1 可通过与 Toll 样受体 4 (TLR4) 结合和激活 NF-κB/p65 信号通路来促进肝细胞中CCL2 的表达,而阻断 CCL2/CCR2 通路可减弱了由 Sparcl1 引起的肝脏炎症反应。因此,Sparcl1 在在 NASH 进展中具有重要作用,可能是治疗NASH的潜在靶标。

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