蛋白质组学样品寄样要求,掌握这几个知识点终生适用!

2021-03-14 15:26:49, 多层组学定制服务 上海欧易生物医学科技有限公司


点击上方“蓝色字体”关注我们

鹿明

生物

蛋白、代谢组学服务专家

关注我们收获更多

关注










“我要送的样品比较特殊,但是想要做蛋白组学,怎么处理可以进行抽提实验?”“做LC-MSMS蛋白鉴定,磁珠样本寄样需不需要干冰保证低温环境?”想必各位伙伴们都在工作、实验中遇到过这样的问题,现在就让实验室里专业的前处理人员来帮我们回答这些问题吧~


首先,寄样需不需要提供冷冻环境,答案是肯定的,蛋白质组学的样本在低温的环境中不易变性,在抽提实验中蛋白的得率就会更高,所以小伙伴们蛋白寄样基本都是需要加上干冰的哦。一般加干冰的量我们按照每天5kg来进行递增计算,本地送样推荐10kg,偏远地区需要20kg


接下来我们来了解一下针对不同类型样本的送样指南,包教包会哦!


一、动物篇

lumingbio


动物组织的样本蛋白量相对较高,送样量的要求也相对比较宽松,一般提供50~100mg的量即可。此外,组织上有血迹、脂肪、结缔组织的还需要用PBS和组织剪将其清理干净。送样前将样品用液氮速冻5min,放置在-80℃保存,送样时需要置于干冰环境中运输。


动物的悬浮培养细胞也是比较热门的蛋白组学研究对象,如果想做细胞的蛋白组学,起码需要107个细胞,离心后收集,置于-80摄氏度环境中。


二、植物篇

lumingbio


植物相较于动物,蛋白占比不高,所以送样在量上面的要求会多一些,推荐送500mg以上的量可以确保实验能够提取到充足的蛋白。如果是种仁、豆类等蛋白含量比较高的,200mg足以完成抽提。


处理样本需要用PBS将样本表面的泥土等杂质冲洗干净,去除掉多余的组织。最好能够保证样本的形态和纯度,不推荐用锡纸包裹,放在EP管中使其形态完整为最佳。用液氮急速冷冻5min后置于-80℃环境中保存,送样时需要添加干冰。


三、微生物篇

lumingbio


微生物比较常规的类型包括细菌和真菌。一般来说108个或200mg的样本量可以保证实验顺利进行。

细菌

细菌的收集方法是通过离心弃上清,收集沉淀后用PBS冲洗数次后,用液氮冷却,置于-80℃储藏。


真菌

真菌一般都是以菌株形态存在,不需要溶液介质,所以用PBS洗净后即可放入管中。同样的冷处理处理方式后,干冰寄样。


四、液体篇

lumingbio


液体样本一般有血清血浆、细胞上清、发酵液、脑脊液等,具体的处理方式这里直接上图给伙伴们参考。


血清

01

1)使用真空采血管收集血液,轻轻地上下颠倒混匀5~6次。

2)4℃ 静置30-60min,让全血凝集;

3)4℃1500-2000×g离心10min,取上清;

4)用移液器将上层淡黄色血清转移到离心管中,加入蛋白酶抑制剂,混匀,瞬时离心;

5)液氮速冻5min,保存于-80℃。

血浆

02

1)使用EDTA抗凝管采集全血,颠倒混匀8~10次,4℃1500-2000×g离心10min,取上清;

2)用移液器将血浆转移到离心管中,加入蛋白酶抑制剂,混匀,瞬时离心;

3)液氮速冻5min,保存于-80℃。

细胞上清液

03

1)在收集前改用不完全培养基培养,即用不加血清的培养基进行培养。

2)待细胞铺满80%左右,用移液枪吸取上清。

3)4℃,6000rpm离心5min,弃去底部可能出现的固体沉淀。

4)液氮速冻5min,冻存在-80℃,干冰寄送。

脑脊液关节液

04

1000g-2000×g离心5min,使用0.22um,滤膜过滤,取上清,液氮速冻5min,-80℃保存,干冰寄送。

发酵液

05

10000 rpm-20000 rpm 离心 30-60 min,(或使用0.22um滤膜过滤),取上清;液氮速冻5min,冻存在-80℃。


五、PCT样品/石蜡样本、动物篇

lumingbio


微量样本(1mg左右)一般是会作为PCT样品进行寄送,除石蜡切片不需要干冰寄样外,其余组织等样品还是需要干冰提供送样低温环境。在数量上的要求一般细胞需要50-100万个细胞以上,穿刺样本等组织需要1-2mg,石蜡切片则需10 µm的石蜡切片10片/样(≥1 mg)


六、LC-MSMS篇

lumingbio


LC-MSMS主要功能是蛋白鉴定,目前我们接收的样本有SDS-PAGE胶条和蛋白磁珠样本。


SDS-PAGE胶条建议大家使用考马斯亮蓝染色(条带清晰,无降解),用EP管装好,不用加任何保存液,用冰袋寄送即可,颜色非常浅的条带可取多个重复样本放一起。胶条只需要常温保存,运输需要放在冰袋环境中即可。


蛋白磁珠样本不建议加loading buffer后100度加热,直接将连着磁珠的蛋白溶液用干冰寄送就好。送样形式也是采用-80 度冻存,干冰运输。


lumingbio

文末看点

本篇文章内容就在此告一段落啦,如果想要了解更多咨询,请关注我们的微信公众号!想要详细了解易明学院该课程的内容,扫描下方的二维码开始深入学习吧!


最后给大家附一个全类型样本送样要求的表格,愿小伙伴们在科研路上硕果累累,早日成为学术大佬!干货满满拿走不谢~


鹿明生物也在后基因组时代的多组学浪潮中,针对我们已有的蛋白组技术、代谢组技术不断地迭代升级,组合创新,希望以最好的技术为科学家们服务,为生命科学研究助力。欢迎咨询鹿明生物最新技术及最新福利活动吧!



猜你还想看


【春季招聘】错过了秋枫冬雪,这个春不再错过你~

3月开学季 | 错过这个省钱攻略,您得多花2万+科研经费!

如何玩转热点研究?蛋白4D-DIA+代谢双平台3h知识干货带您入门!

15分钟能鉴定出多少磷酸化位点?-DIA方法为高通量磷酸化蛋白质组学提供新工具

4D-DIA技术:4D-DIA技术 | 蛋白质组学领军科学家带您走进4D组学新时代

4D-DIA技术:"稳中带皮"跨实验室比较展示基于DIA的质谱工作流程稳定性及潜力

GC/LC双平台技术:项目文章| Circulation,IF=23.054复旦大学重点实验室发表颗粒物暴露与应激激素水平试验研究

GC/LC双平台技术:项目文章 | 中国农科院茶叶研究所陈亮博士对白化茶和绿茶品种代谢变化的研究

GC/LC双平台技术:双平台代谢组学 | 基于LC-MS和GC-MS的非靶向代谢组学研究印楝素对背侧双歧杆菌幼虫的影响

4D-DIA专刊(阅读量:5709)4D-DIA白组学 | 鹿明生物


END

家橙老师 撰文

欢迎转发到朋友圈

本文系鹿明生物原创

转载请注明本文转自鹿明生物

我知道你在看

点“阅读原文”了解更多


  • 客服电话: 400-6699-117 转 1000
  • 京ICP备07018254号
  • 电信与信息服务业务经营许可证:京ICP证110310号
  • 京公网安备1101085018
  • 客服电话: 400-6699-117 转 1000
  • 京ICP备07018254号
  • 电信与信息服务业务经营许可证:京ICP证110310号
  • 京公网安备1101085018

Copyright ©2007-2024 ANTPEDIA, All Rights Reserved