2020年Octet互作仪器研究成果之“最”

2021-01-15 04:31:45, 赛多利斯 德国赛多利斯集团


2020年,注定是不平凡的一年。

年初正值疫情爆发,中国团队厉兵秣马,为研究疫情的科学家们提供最大力度的支持保障;年中又逢赛多利斯公司的收购,团队在最短时间内顺利完成和新公司的整合。

Octet


在2020年,平均每天有四篇引用Octet/BLItz互作分析相关数据的文章被发表(数据来自于sci-hub)。年度发表文章总数比去年大涨50%,而CNS的文章更是达到了51篇——其中有8篇来自于中国用户(点这里了解详情)。另外平均每天还有3项专利的发表用到了Octet/BLItz数据(Espacenet Patent Search)。

仪器好不好,关键要客户说好才行。持续高速度增长的文献和专利就是最好的证明!

在此,陈老湿就从这些研究成果中挑选几个“之最”,以飨读者:

Octet助力第一个 
上市的新冠疫苗!

对全人类健康
贡献最大

辉瑞的mRNA疫苗(BNT162b2)是第一个在全球范围内大规模使用的新冠疫苗,于2020年12月初在英国获得紧急使用授权。在欧盟药物管理局(EMA)的评估报告中(assessment report)中,研究人员使用生物层干涉技术(BLI)测定了RNA表达产物的结合活性【1】

(设备型号:Octet RED384)左图用SA传感器固化含有avitag的ACE2-PD。右图用proG生物传感器固化抗体,检测与不同浓度的P2 S(疫苗表达产物)的结合亲和力。两者的KD在nM级别【2】

除去辉瑞的RNA疫苗,有多个其他新冠疫苗都用到Octet检测疫苗活性(详情点这里)。

Octet凭借其良好的重复性和准确性,已经成为全球各国药物审核机构认可的技术,被广泛地用于IND以及NDA申报。

最热门
的使用者

2020年诺奖获得者
都用上Octet!

Charles Rice和另外两位科学家由于发现了丙肝病毒而获得了2020年诺贝尔生理学或医学奖。他与洛克菲勒大学的同事于今年6月在Nature杂志上联合发表了一篇文章,主要研究新冠肺炎患者个体在恢复期内的新冠病毒血清抗体反应。本文应用Octet Red96e系统做了抗体表位分组实验。

用Protein A生物传感器固化第一个抗体(Ab1),依次结合RBD和第二个抗体(Ab2),通过响应信号的数值大小判别这些抗体是否结合不同的表位。详细请点击:诺奖获得者教你做分子互作竞争实验

Octet分子互作仪在表位分组或者竞争实验中有着很大的优势。与传统的ELISA方法相比,实验设计灵活,操作简便,样品无需标记。系统配有专门的表位配对分析软件,只需轻点几下鼠标,表位数据轻松搞掂!

中和抗体研发  
离不开Octet!

应用最多
的领域

Octet在多个新冠中和抗体和药物的发现中起到了重要作用(详情点这里)。在2020年的51篇CNS中,有20篇是关于病毒中和抗体的研究,特别是新冠中和抗体。比如:

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治疗川普神药,再生元的REGN-COV2(详情点这里

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第一个中和抗体—乌得勒支大学47D11(详情点这里

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Vir Biotechnology/华盛顿大学的S309/S304【3】

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军事科学院陈薇组的4A8中和抗体【4】

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君实的JS016中和抗体【5】

Octet与其他互作技术相比,具备通量高和粗样品耐受度高等优点。非常适用于研发上游阶段的候选药物筛选,也可以用于下游阶段的细胞株建立与生产工艺开发,以及质量控制与分析,妥妥的生物制药企业必备设备之一。

最热门
的技术

蛋白体外设计技术
的C位技术

2020年生命科学最热门的C位技术当属蛋白质体外设计。蛋白质设计大师David Baker多篇CNS都用到Octet来检测体外设计蛋白的亲和力,包含最强的新冠病毒抑制剂设计(详情点这里)。

Neoleukin医疗公司利用复杂的计算方法从头设计与SARS-CoV-2刺突蛋白(S蛋白)结合的蛋白诱饵(protein decoy)。这些蛋白诱饵(编号CTC-445.2d)高亲和力地结合S蛋白,从而吸引新冠病毒的“火力”,阻止S蛋白与病毒受体hACE2结合,进一步阻断SARS-CoV-2感染人体细胞。这项研究已发表于《Science》【6】

以CTC-445起始设计的候选药物。CTC-445.2是亲和力成熟以后的CCT-445,CTC-445.2d是二聚化后的CTC-445.2。Octet检测发现,这些蛋白诱饵与S蛋白的1结合亲和力依次增加。

计算机AI预测的再神,最终也需要通过实验来验证。特别是计算机惊人的算力,设计出的候选样品往往数量很多,所以特别适合Octet发挥高通量的特长!

180Da小分子,
Octet手到擒来【7】

分子量最小
的样品

法国格勒诺布尔大学建立了BLI技术检测核酸适配子与L-Tyrosinamide(180Da)的相互作用。此前的报道中,用SSA传感器检测的最小分子量是129Da(二甲双胍)。本文详细比较了SA和SSA生物传感器固化适配子,检测小分子的结果。另外文中还发现固化高度与结合高度呈正比,说明结合的特异性,且两种传感器检测的结果完全一致。

左边为SA传感器检测结果,右边为SSA传感器检测结果。

还担心Octet检测小分子样品的灵敏度吗?Octet深藏blue功与名。

最有前途
的新应用

跨界抗体药物
制剂优化
【8】

在进入CMC开发之前,对候选抗体药物开展可开发性评估,可降低因制造和稳定性问题从而导致研发失败的可能性。候选抗体不仅应显示出对靶点有高亲和力,且尽可能降低自身相互作用,使得抗体稳定性更好,以降低形成聚集体的可能性。

德国制药公司MorphoSys开发了自相互作用生物层干涉法(SI-BLI),并应用于可开发性评估(包括对预制剂的评估)中。研究发现基于SI-BLI的制剂筛选结果,和DLS(动态散射)以及粘度测量值三者高度相关。SI-BLI对原料需求少,样品制备简单。因此,BLI可以在可开发性的早期阶段用来评估抗体自身相互作用。

用AHC(anti-human Fc)生物传感器固化抗体,用1uM Fc封闭,再和2uM同样的抗体结合。可见His-HCL缓冲液对这个抗体的自聚倾向最大,与Na +相比,Mg2 +对抗体自聚的抑制作用明显更大。


Octet


Octet分子互作仪的便捷性和准确性,在充满疫情影响的2020年发挥了极大的作用,为人类健康事业做出了自己的贡献,更得到药物评审机构和广大科研用户的认同。

陈老湿相信,Octet和大家一样能够迎接更加光明的2021!


-参考文献-

  1. Vogel et al., (2020). A prefusion SARS-CoV-2 spike RNA vaccine is highly immunogenic and prevents lung infection in non-human primates. bioRxiv, doi: https://doi.org/10.1101/2020.09.08.280818

  2. Livogiva assessment report. Procedure No. EMEA/H/C/005087/0000

  3. Cross-neutralization of SARS-CoV-2 by a human monoclonal SARS-CoV antibody. Nature, 1-10, 18 May 2020

  4. A noncompeting pair of human neutralizing antibodies block COVID-19 virus binding to its receptor ACE2. Science 13 May 2020:eabc2241

  5. Potent neutralizing antibodies against SARS-CoV-2 identified by high-throughput single-cell sequencing of convalescent patients’ B cells. Cell

  6. De novo design of potent and resilient hACE2 decoys to neutralize SARS-CoV-2. , Science 370, 1208–1214 (2020)

  7. ACS Sens.,DOI: 10.1021/acssensors.0c00925

  8. Analysis of antibody self-interaction by bio-layer interferometry as tool to support lead candidate selection during preformulation and developability assessments. International Journal of Pharmaceutics 589 (2020) 119854



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