Frontiers in Microbiology | 李后开教授团队多维度评估了不同粪便样本保存条件对肠道微生物谱的影响

2020年5月27日，上海中医药大学交叉科学研究院李后开教授团队在微生物学权威期刊《Frontiers in Microbiology》(IF=4.259) 在线发表了题为“ Variations of gut microbiome profile under different storage conditions and preservation periods: A multi-dimensional evaluation” 的研究论文[1]。此项研究基于16S rRNA基因测序系统地评估了不同的粪便样本保存条件，保存时间及测序平台对于肠道微生物谱的多维度影响。

近年来，大量的研究表明肠道微生物失调与肥胖症、糖尿病、非酒精性脂肪肝病、心血管疾病、甚至癌症等密切相关。高通量测序技术（16S rRNA基因和宏基因组学）的进步也为研究肠道菌群在人类疾病中的作用奠定了坚实的基础。据统计，基于16S rRNA基因测序的微生物相关文章每年高达数千篇，然而，不同研究之间肠道微生物组的数据通常表现出较高的不一致性。值得注意的是，微生物研究中的各个环节都可能引起菌群结果的差异，尤其是粪便样本储存条件，但既往研究对于粪便样本保存条件的评估也存在不一致性。此外，涉及肠道菌群的大规模临床研究正在迅速增加，然而低温条件对于临床样本，尤其是边远地区样本的储存及运输很难实现。商业化常温保存试剂的出现为临床采样提供了更多的选择，进一步满足了临床的需求。因此，系统评估不同样本保存条件对于肠道微生物谱的影响对未来微生物相关的研究具有一定的指导意义。