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代谢组学简介


代谢组学(Metabonomics/Metabolomics):是通过考察生物体系(细胞、组织或生物体)受刺激或扰动后(如将某个特定的基因变异或环境变化后),其代谢产物的变化,来研究生物体系的一门科学。          

        代谢组:(metabolome):是基因组的下游产物也是最终产物,是一些参与生物体新陈代谢、维持生物体正常生长功能和生长发育的小分子化合物的集合,主要是相对分子量小于1500的内源性小分子。 

        代谢物数量因物种不同而差异较大: 植物(200 000种)、动物(2500种)、微生物(1500种)。

  • 核磁共振技术(NMR)

    优点:无损伤性,无偏向性,方法灵活,处理简单,无辐射性

    不足:灵敏度较低,动态范围有限


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  • 气相色谱与质谱联用技术(GC/MS)

    优点:高分辨率,高灵敏度,有比较完整的数据库,易于定性

    不足:需衍生化,预处理繁琐


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  • 液相色谱与质谱联用技术(LC/MS)

       优点:灵敏度较高,较宽动态范围,无需衍生化

       不足:标准谱图库信息不全,不易定性

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  • 数据分析

     去噪、解卷积


     搜库、峰对齐


     归一化、去冗余、降维转化

     Excel、MATLAB


     多元统计分析

     simca-p、metaboanalyst、SPSS


     差异物筛选

     VIP、p value


  • 代谢组学分析流程

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