对于一个已经面临巨大成本压力的行业来说,发现新药过程中的任何效率提升都是值得关注的。从苗头化合物的发现、先导化合物及先导化合物的优化、筛选临床候选药物这个过程,化合物的结构验证需求贯穿始终。为了获得临床候选化合物,通常会合成约2000种化合物并对其所需活性进行测试,在整个过程中,确保被测化合物结构正确、纯净且均匀存在是至关重要的,化合物的结构如果不正确,即使被测试并由于没有活性而被丢弃,也会导致对构效关系的错误判断[1, 2]。
Mnova 软件提供Verify这一功能插件,基于NMR和/或LC/GC/MS数据对化合物结构进行验证。同时,由于软件中集成了功能强大的NMR、MS数据处理分析功能,并以创新性的NMR Predict功能作为辅助,目前,被越来越广泛的应用于在提交给公司化合物库和生物分析之前快速排除掉错误结构。
对于数据量大、涉及多公司多部门数据传输、有数据监督及规范需求的医药、化工公司等用户,Mnova Verify也可以通过全自动的方式运行,即Mnova Gears Verify。
功能特征
1. 工作流程清晰、数据可靠

Mnova Verify由几个工作模块组成,这些模块相互作用,提供最终结构验证的结果。
l 自动处理和分析1D&2D NMR实验数据(1H NMR,HSQC);
l 自动处理、分析LC/GC/MS实验数据;
l 为候选结构生成预测数据(1H、13C、HSQC谱图预测—Mnova NMRPredict;m/z、isotopic cluster、碎片和MS/MS预测);
l 将实验数据与预测数据进行对比;
l 使用新型评分系统展示/报告结果。
2. 简单灵活的评分系统
评估分析数据,对候选结构作出兼容性判断,输出包括:
l 每个候选结构的总结性分数结果
l 软件应用的详细测试参数结果
然后系统会对提出的结构进行排序,并快速告诉您哪一个更适合实验数据。如果结果不理想或需要修改参数,可以轻松地在Mnova中对数据进行重新处理。
3. 可以实现结构验证的自动化


Mnova Gears Verify在后台运行Mnova Verify,以将化合物结构验证集成到全自动工作流中。
它可以快速有效地分析实时或大批量采集的数据,并自动生成定制化报告,而且可以同步保存到数据库中,便于审查,这一功能的实现将减少重复劳动,大大提高工作效率!
应用场景

视频
关于Mnova软件进行化合物结构验证及其自动化方案的详细介绍及操作演示请见视频:https://www.bilibili.com/video/BV1cG4y1h7ym
参考文献:
1. DiMasi, J. A.; Grabowski, H. G.; Hansen, R. W., Innovation in the pharmaceutical industry: New estimates of R&D costs. J Health Econ 2016, 47, 20-33.
2. Lumley, J. A.; Sharman, G.; Wilkin, T.; Hirst, M.; Cobas, C.; Goebel, M., A KNIME Workflow for Automated Structure Verification. SLAS Discov 2020, 25 (8), 950-956.