nrStar™ Functional LncRNA PCR芯片技术服务

型号	品牌	PIPES指数
K10013	量准	7.5
microRNA芯片服务	沃森生物	5.0
人癌症 lncRNA PCR 芯片human Cancer lncRNA PCR array	英拜生物	5.0

仪器描述

Arraystar公司zei新推出的nrStar™ Human Functional LncRNA PCR Array，可同时检测372个功能已知或疾病相关的金标准lncRNA。这些lncRNA精心挑选于科学文献和zei新数据库。与大部分功能未知、序列残缺的lncRNA相比，产品中的lncRNA特征明确、信息完善。Arraystar为这些lncRNA提供了详细的注释信息，包括生物学功能（干细胞分化、胚胎发育、心血管发育、造血系统与免疫、内分泌系统……）和作用机制（基因表达调控、表观遗传、基因组印记、染色体修饰……）等。lncRNA表达失调还与和神经退行性疾病、心血管疾病、糖尿病和癌症等病理特征紧密相关。另外，LncRNA在表达分布和组织/疾病特异性上高于mRNA，已有不少已知或未知功能的lncRNA被认为具有分子标志物潜能。比如，PCA3已通过FDA认证，应用于前列腺癌的临床诊断。

Arraystar功能性lncRNA PCR芯片不仅含有zei佳的内容，而且具有zei优的技术表现。通过靶向特定的外显子或可变剪接位点，每对lncRNA引物可以检测到特定的转录本，从而区分同一lncRNA基因的不同转录本亚型。“机智”的cDNA合成策略保证了从完整或降解的RNA样本检测多聚腺苷酸尾和非多聚腺苷酸尾lncRNA的有效性。严格的外参、内参设置以及可信度高的均一化策略，保证了高质量的qPCR结果及其精确定量，可充分满足临床诊断应用或分子标志物鉴定所需。

nrStar™ Human tRF&tiRNA PCR芯片服务列表

服务	芯片	规格	描述
*NEW* nrStar™ Human Functional LncRNA PCR Array Service	*NEW* nrStar™ Human Functional LncRNA PCR Array	384-well plate	同时检测372个功能已知或疾病相关的金标准lncRNA

芯片特点
● 覆盖zei新zei全的已知功能lncRNA：从zei新数据库和科研文献中收集了372个与生物学过程和疾病明确相关的LncRNA转录本。PCR芯片包含目前市场上zei新zei全的已知功能LncRNA。

●强效检测：无论样本是否降解，lncRNA是否有Poly(A)尾，都可被Arraystar“机智”的流程所检测，得到高质量的数据结果。

●zei可靠和zei精准的lncRNA定量检测：通过使用一系列严格的外参和内参，芯片中的每个LncRNA转录本都能被准确和可靠的定量检测。与常规使用一个内参基因不同，Arraystar公司产品使用生物信息学方法从多个候选内参基因中挑选出zei适的内参基因进行数据均一化。

●转录本特异性检测：通过靶向特异性的外显子或可变剪接位点，芯片中的PCR引物准确有效的检测每个LncRNA转录本。

●稳定有效的PCR引物： 所有LncRNA引物均经过精心优化，并在多种细胞和组织中通过验证。

●简单便捷： 384孔板，即拆即用。只需将反转好的cDNA与qPCR Master Mix混合，加入到384孔板，即可进行qPCR反应。所有流程可在4小时内完成。

康成Functional LncRNA PCR芯片服务实验流程
1.RNA抽提与质量检测
进行RNA常规抽提，使用NanoDrop ND-1000检测RNA浓度和纯度，使用琼脂糖凝胶电泳检测RNA纯度和完整性。详细的样品QC结果见Arraystar服务报告。

2.cDNA合成
每样本取1.5 μg RNA，使用rtStar™ First-Strand Synthesis Kit (Cat# AS-FS-001, Arraystar) 试剂盒进合成cDNA第一链。详细步骤参照Arraystar产品操作手册。

3.Real-time PCR扩增
将cDNA与 Arraystar SYBR Green qPCR Master Mix (Cat# AS-MR-005-5, Arraystar)混合，加入至384孔板中，在ABI 7900 PCR仪上进行Real-time PCR扩增。

4.熔解曲线分析与原始数据导出
PCR扩增完成后，进行熔解曲线分析，使用PCR仪自带软件导出原始数据。出具Raw Data文件夹，包含原始Ct值、PCR扩增曲线图和熔解曲线图。

康成Functional LncRNA PCR芯片服务数据分析流程
1.PCR芯片数据质控
质控参数：Ct(Blank)>35; Ct(GDC)>35; Ct(RNA Spike-in)<25; Ct (PPC) <25. 符合上述条件的样本进入下一步分析。数据QC结果见Arraystar服务报告。

2.数据校正与△Ct值计算
板间校正：使用Ct(PPC)对不同PCR板进行板间校正。
内参校正与△Ct值计算：挑选zei优内参，使用内参均值计算△Ct值。

3.差异倍数计算 (2^(-△△Ct))
使用 △△Ct 方法计算不同样品组之间的表达差异倍数。

4.P值计算
对样本组进行t检验，计算P值。

5.其他常规数据分析
散点图分析；火山图分析；TOP20表达上调和下调LncRNA柱形图分析

6.提供服务报告与数据分析结果
a.Arraystar服务报告（包括RNA样本QC、qPCR数据QC和详细实验数据分析步骤）
b.Excel芯片结果汇总表（包括tRNA列表，数据分析结果和各类图表）
c.Raw Data文件夹 (包含原始数据、扩增曲线图和熔解曲线图)