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细胞功能预测和信号通路研究工具箱背景介绍基因功能预测工具在筛选出有意义的基因并对其进行验证之后,可以对这些基因进行功能预测,以使后续的功能研究实验更有的放矢。伯豪自主开发的基因功能预测工具,可对非编码RNA与miRNA、非编码RNA与蛋白/转
背景介绍
基因功能预测工具
在筛选出有意义的基因并对其进行验证之后,可以对这些基因进行功能预测,以使后续的功能研究实验更有的放矢。伯豪自主开发的基因功能预测工具,可对非编码RNA与miRNA、非编码RNA与蛋白/转录因子、ceRNA、下游靶基因/相互作用基因等,进行功能预测。
信号通路研究工具
一般情况下,信号通路的变化会通过转录水平和蛋白磷酸化水平体现出来,那么这种变化可以用基因芯片、PCR-array、蛋白芯片/磷酸化因子检测,然后用高级分析共表达&IPA,生物信息学的方法进行分析。IPA (Ingenuity Pathway Analysis) 是一个一体化的在线整合分析软件,其背后的数据库包含 500 多万条生物学知识。数据经由 500 多名与家多轮质控,收集自 300 多种顶尖杂志的全文、 3000 多种生物学杂志摘要和 30 多个公共数据库,包含人、小鼠、大鼠等物种的基因表达数据、microRNA 数据和小规模实验数据,并且每周更新最新文献,每季度更新分析功能。IPA的分析内容包括:功能疾病相关性分析,生物学下游效应分析,经典通路相关性分析,通路活性效应预测,转录调控分析,转录因子互作分析,相互作用网络分析,生物标志物筛选,功能、疾病背景分子查询,相应文献调研及对应通路绘制等。伯豪生物可进行一系列的IPA分析。
差异基因功能注释流程图
技术路线
服务形式
仅生信分析:客户提供每组数据3个或3个以上生物学重复并且为差异基因或者关注的部分基因。公司提供图片文件(Network图),包括png、PDF格式;Cytocape文件:可以cytoscape打开进行细节调整;文本文件。实验+生信分析:客户提供基因信息,疾病信息,活细胞或细胞类型、培养条件信息,及需要进行实验类型。公司提供实验报告(材料、试剂、仪器、方法、实验结果)和生信分析结果。
经典文献:
Shan-Shan Lai et al., PP2Acα positively regulates the termination of liver regeneration in mice through the AKT/GSK3β/Cyclin D1 pathway. Journal of Hepatology.
细胞功能预测和信号通路研究工具箱价格
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