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传统表达谱芯片的探针针对mRNA的3’端,不能检测可变剪接、3’末端没有PolyA化等变化。针对这种情况,芯片厂家开发了外显子表达谱芯片(Exon Array),对于每个外显子均设计相对应的探针,检测每个外显子的表达,从而达到检测mRNA各种
传统表达谱芯片的探针针对mRNA的3’端,不能检测可变剪接、3’末端没有PolyA化等变化。针对这种情况,芯片厂家开发了外显子表达谱芯片(Exon Array),对于每个外显子均设计相对应的探针,检测每个外显子的表达,从而达到检测mRNA各种变化的目的。
SBC可为客户提供Affymetrix外显子表达谱芯片服务和Agilent外显子表达谱芯片服务。
与传统表达谱芯片探针设计的差别:
外显子表达谱芯片对每个外显子(Exon)均有覆盖;传统表达谱芯片只覆盖mRNA的3’端。
外显子表达谱芯片与传统表达谱芯片检测项目的差别:
传统表达谱芯片只能检测正常表达的mRNA;外显子表达谱芯片除了正常表达的mRNA外,还能检测可变剪接和正常mRNA的一些变体。
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