一、miRNA芯片
microRNAs(miRNAs)是一种大小约21—23个碱基的单链小分子RNA,是由具有发夹结构的约70—90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶加工后生成,不同于siRNA(双链)但是和siRNA密切相关。microRNA通过和靶基因mRNA碱基配对引导沉默复合体(RISC)降解mRNA或抑制mRNA的翻译,从而在转录后水平调控蛋白表达(最新发现microRNA也能在转录水平调控基因表达)。microRNA在物种进化中相当保守,在动物、植物和真菌等中发现的microRNAs表达均有严格的组织特异性和时序性。microRNA在细胞生长和发育过程中起多种作用,包括调控发育、分化、凋亡和增殖等。
二、Agilent miRNA芯片技术特点
1. 唯一能通过特殊的探针设计区分成熟miRNA和miRNA前体的芯片平台;
2. 无需分离miRNA,直接用Total RNA 进行实验,只需100ng的Total RNA 即可用来进行标记实验(不包括质检所消耗的量),避免了分离、富集、放大等过程带来的影响;
3. 样品适用范围广:组织、血清、血浆、FFPE、冰冻切片组织、脱落细胞等均可进行实验;
4. 高特异性:特殊的专利探针设计能区别一个碱基的差异;
5. 高灵敏度:检测丰度跨4个log,最高可达6个log,只要存在6000个拷贝的分子就可以检出;
6. 数据来源于Sanger 19.0版本,并方便及时更新;
7. 人、大鼠、小鼠之外的动物物种,可以方便的通过earray进行个性化定制。
三、miRNA芯片种类:
四、miRNA芯片应用:
检测miRNA表达水平、差异miRNA筛选、差异miRNA靶基因预测
五、miRNA芯片样品要求 :细胞、新鲜组织或总RNA样品。
1、样品量:细胞样品请提供至少5×106个细胞,组织样品请提供至少100mg的组织块或切片。总RNA样品请提供总量10μg以上。
2、样品质量:RNA无明显降解,OD260/280值在1.9和2.1之间,浓度≥ 100ng/μl;DNA应该去除干净。
3、细胞样品或新鲜组织块(切成~50mg的小块)直接液氮冻存后,-80℃保存。
4、样品运输:细胞或者组织样品;或者总RNA样本置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰运输。
六、服务流程:
威斯腾生物服务项目
分子生物学检测 | 蛋白质与免疫学 | 动物实验 |
实时荧光定量PCR | 单克隆抗体制备 | 帕金森疾病模型 |
免疫共沉淀(Co-IP) | 多克隆抗体制备 | 抑郁症动物模型 |
ELISA(酶联免疫吸附法)技术 | Western-blot 实验服务 | 脊髓损伤模型 |
生化指标检测 | 蛋白双向电泳实验服务 | 脑外损伤模型 |
双荧光素酶报告基因检测 | 原核蛋白表达纯化 | 骨神经损伤模型 |
染色质免疫共沉淀(ChIP) | 真核蛋白表达纯化 | 心肌缺血模型 |
GST pull Down | ITRAQ定量蛋白质组学 | 心力衰竭模型 |
| SILAC蛋白组学 | 肺动脉高血压动物模型 |
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| 高血压模型 |
病毒包装 | 实验课题整体外包 | 粥样动脉硬化模型 |
过表达/干扰慢病毒包装纯化 | 整体课题外包 | 大脑中动脉阻塞模型 |
过表达/干扰腺病毒包装纯化 | 细胞整体实验外包 | 慢性之气管炎模型 |
逆转录病毒包装纯化 | 动物整体实验外包 | 过敏性哮喘模型 |
腺相关病毒包装纯化 |
| 肺炎大鼠模型 |
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| 肝炎-肝硬化-肝癌模型 |
蛋白芯片 | 原代细胞培养 | 肝纤维化模型 |
细胞因子芯片 | 骨髓间充质干细胞培养 | 胆结石模型 |
BioPlex悬浮芯片 | 脂肪干细胞培养 | 急性胰腺炎模型 |
生长因子芯片 | 心肌成纤维细胞培养 | 急性肾衰竭模型 |
炎症因子芯片 | 软骨细胞培养 | 体内血栓模型 |
血管生成因子芯片 | 血管内皮细胞培养 | 关节炎模型 |
凋亡因子芯片 | 神经元细胞培养 | I型和II型糖尿病模型 |
趋化因子芯片 | 内皮组细胞原代培养 | 裸鼠成瘤 |
HuProt TM 20K人类蛋白组芯片 |
| 基因编辑动物 |
| 电生理相关服务 | 动物整体实验服务 |
| 膜片钳实验 |
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细胞生物学检测 | 高通量测序 | 代谢组学 |
细胞原代培养 | mRNA测序 | 气相色谱GC/MS |
MTT检测 | LncRNA测序 | 液相色谱LC/MS |
细胞凋亡检测 | 全基因组测序 | 核磁共震NMR |
细胞周期检测 | RNA-Seq测序 |
|
细胞克隆形成实验 | 外显子测序 | 影像学相关实验 |
Transwell细胞迁移/侵袭 | 16s扩增子测序 | Micro-CT |
流式分选 | Small RNA测序 | 小动物活体成像 |
CCK8/XTT检测 | 宏基因组测序 | 核磁共振 |
台盼蓝检测细胞活性 | 单细胞测序 | PET-CT |
药物筛选细胞学实验 | circleRNA测序 |
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细胞粘附性检测 | 甲基化测序 | 基因编辑动物 |
细胞划痕实验 |
| 条件性敲除小鼠/大鼠 |
细胞生物学整体实验 |
| 全基因敲除小鼠/大鼠 |
细胞成管实验 |
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病理检测 | CRISPR/Cas9细胞敲除/敲入 | 基因芯片 |
扫描电镜 | 基因定点突变细胞系 | LncRNA芯片 |
透射电镜 | 单基因敲除细胞系 | miRNA芯片 |
HE染色 | 多基因敲除细胞系 | mRNA芯片 |
免疫组化 | 目的基因敲入细胞系 | 甲基化芯片(限人和小鼠来源样本) |
Tunel(原位末端凋亡法)检测 | 报告基因敲入细胞系 | SNP芯片(限人和小鼠来源样本) |
激光共聚焦 | miRNA/LncRNA敲除细胞系 |
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免疫荧光 |
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Masson染色 | CRISPR/Cas9动物敲除/敲入 | 科研设计指导&文章评估/润色 |
原位杂交 | 基因敲除大鼠/小鼠 | 科研文献论著翻译 |
荧光原位杂交 | 基因敲入大鼠/小鼠 | 论文翻译润色服务 |
特殊染色(PSA、茜素红、阿尔新蓝等) |
| 临床实验/科研实验设计方案指导 |
行为学检测 | 药物筛选服务项目 | 药效学评价 |
旷场实验 | 高通量自动药物筛选平台 | 抗肿瘤药物药效学评价 |
重复性刻板行为检测 | 细胞高内涵药物筛选平台 | 心血管系统药物药效学评价 |
动物跑台检测 | 蛋白质组学靶标研发平台 | 泌尿系统药物药效学评价 |
强迫游泳 | 分子药理研究平台 | 内分泌系统药物药效学评价 |
| 生物膜片钳药物筛选平台 | 抗炎免疫药物药效学评价 |
| 常规药物体外筛选 |
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