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宏基因组 ( Metagenome)(也称微生物环境基因组Microbial Environmental Genome, 或元基因组)是由 Handelsman 等 1998 年提出的新名词,即环境中全部微生物遗传物质的总和。宏基因组学(Metagenomics),一般指通过直接从特定生态环境样品中提取全部微生物的DNA,进行较高通量测序分析,研究环境微生物的群落结构、物种分类、系统进化、基因功能、代谢网络及与其所在的生态环境间的互作情况等的一门学问。
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