微生物多样性测序生物领域各个研究方面,如:
▶ 农林领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种保护研究等;
▶ 畜牧业:肉类及乳品质研究,致病机理研究等;
▶ 基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等;
▶ 生物医药:药物作用机理,药效评价,药物开发等;
▶ 生物能源、环境科学领域:发酵过程优化,生物燃料生产,环境危定风险评估研究等;
数据分析
分析内容 | 解决问题 |
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OUT聚类及物种注释 | 各样本的OUT聚类和注释结果 |
物种组成分析 | 各样本/分组在门、纲、目、科、属分类水平上的组成信息 |
进化分析 | 研究物种的系统进化关系 |
样品复杂度分析(Alpha多样性分析) | 分析各样品内微生物群落的多样性 |
样本比较分析(Beta多样性分析) | 分析各样本间的差异 |
组间群落结构差异分析 | 分析组间微生物群落结构的差异是否显著 |
组间物种差异分析 | 寻找组间具有显著差异的物种 |
技术优势
▶ 样本类型广泛:粪便、内容物、土壤、水体、淤泥、发酵物等样本
▶ 灵活:多种测序策略可满足16S/18S/ITS不同高变区域的研究需求
▶ 鉴定到“种”,准确性高:菌群多样性鉴定精细到“种”,分类更明确;从碱基保守水平测定,真实反映物种情况
▶ 平台优,数据质量高:基于优质的Illumina测序平台,数据质量高,Q30>85%;
▶ 质控严格:严格的质控管理,确保每一个环节都出色完成
▶ 分析内容丰富:可选择与宏基因组、宏蛋白组、代谢组联合分析,分析内容更丰富。
参考文献
1. Gut bacterial diversity of the tribes of India and comparison with the worldwide data. Scientific Report 2016, IF=5.228
16S rDNA扩增子测序,研究不同部落印度人肠道微生物的多样性
2. Combined Signature of the Fecal Microbiome and Metabolome in Patients with Gout. Frontiers in Microbiology 2017,IF=4.076
16S rDNA扩增子测序+代谢组─挖掘痛风患者菌群-代谢相互之间的作用关系
3.
Dysbiotic gut microbiota causes transmissible Crohn’s disease-like
ileitis independent of failure in antimicrobial defence. Gut 2016,
IF=14.921
16S rDNA扩增子测序+宏蛋白组学,肠道微生物在慢性回肠炎疾病进展中的作用机制
4. The
Dynamics of the Human Infant Gut Microbiome in Development and in
Progression toward Type 1 Diabetes. Cell Host & Microbe
2015,IF=12.552
16S rDNA扩增子测序+宏基因组+代谢组─研究婴儿肠道微生物在Ⅰ型糖尿病发病过程中的动态变化
微生物多样性测序可用于农林领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种保护研究等;,微生物多样性测序
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