However, the dynamic range of protein concentration in these samples poses a challenge for in-depth proteome quantification. PASEF® is a powerful technology for rapid in-depth and sensitive proteome quantification that is also applicable to biofluids like plasma and serum. We combined PASEF with high-throughput gradient settings for the analysis of hundreds of plasma and serum samples and quantified several hundred protein groups routinely in 21- and 47-minute runtimes. The timsTOF Pro coupled with the Evosep One nanoflow UPLC delivers quantitation with median CV less than 20% and quantified more than 70 known biomarkers in a study investigating over 700 COVID-19 serum samples.
建立在 shotgun 蛋白组学标准上的 timsTOF fleX 将布鲁克一流的 4D-组学分析与尖端的 MALDI 成像技术整合于一个平台,包括高频率的 smartbeam 3D 激光器。配置有双离子源的 timsTOF fleX,把持久稳定的 ESI 分析和组织分子空间分布集成于一体,是进行空间定位组学研究的理想平台。在此之前,没有质谱仪能为组学研究者同时提供这两种能力。
ESI 和 MALDI 的切换操作,只需在软件中开启 smartbeam 3D 激光源,仅需几秒即可完成。简单的切换操作意味着从组学深度鉴定和定量流程到组织高清成像的方便转换,又不影响效率和功能,从而发现真正有用的信息。
增加 MALDI 成像新维度,挖掘更多信息
由 MALDI 和 ESI 产生的离子,经过同一路径从离子源到达探测器,因此 MALDI 工作流程可以利用 timsTOF HT 的主要优势,包括根据分子碰撞截面 ( CCS ) 来进行捕集离子淌度分离( trapped ion mobility separation,TIMS )。调谐和校准可在 ESI 模式下进行,并用于 MALDI 模式,方便了仪器的优化。