应用案例：在 Nature Communications 刊发的坏死性凋亡研究中，研究团队利用谱度众合激酶底物鉴定技术，精准证实并确定了激酶 MST1 与底物 MLKL 发生特异性结合，并直接定位于催化底物 Thr216 位点发生磷酸化修饰；在 Journal of Experimental Medicine 发表的研究中，鉴定出 ALK2/3 胞内段 Thr203 磷酸化，明确了其调控 T 细胞免疫突触组装的机制。

场景二：微观动态互作组学——理化/环境应激与药物干预下的时空动态解析

需求特点：蛋白之间的作用在生理变化下动态调整，需对比给药后、缺氧或生理刺激下调控激酶解离/招募情况。

适配产品：IP-MS / PL-MS 动态互作组学（多实验组平行设计 + Mfuzz时间序列趋势聚类）。

应用案例：在 Journal of Advanced Research 刊发的同济医院研究中，探讨了脂多糖（LPS）诱导炎症状态下，转录辅助因子 TLE3 通过激活底物 DEAD-box 解旋酶 DDX5 及相关调控通路的保护机制，利用谱度众合IP-MS数据顺利完成了关键信号互作网络的构建。

场景三：肿瘤耐药、铁死亡阻断及代谢重塑机制

需求特点：探索肿瘤细胞为何对化疗或免疫治疗耐药，尤其是关键代谢酶的非经典磷酸化修饰调控。

适配产品：高深度磷酸化定量蛋白质组学 + 靶点 PPI 互作网络。

应用案例：华中科技大学同济医学院团队在 Cancer Communications 刊发成果，利用谱度众合靶向质谱体系，锁定激酶 AKT 深度催化底物 PCK1 发生非典型 Ser90 磷酸化，该修饰重塑了PCK1-LDHA互作机制，阐明了 intrahepatic cholangiocarcinoma（肝内胆管癌）对辛伐他汀等化疗/免疫治疗耐药及铁死亡抵抗的底层机理。在 Cell Death and Differentiation 的成果中，助力上海交大团队揭示 ATOH8 转录因子通过抑制 SCD 表达调控铁死亡的机理。

场景四：病原体感染应答与宿主靶标泛素化/磷酸化修饰调控

需求特点：解析病毒侵入细胞后，如何劫持宿主激酶系统，或调节宿主泛素连接酶复合物以逃避先天免疫。

适配产品：高通量 IP-MS 互作筛选 + 泛素化（Di-Gly残基捕捉）/ 磷酸化修饰定量。

应用案例：武汉病毒所团队利用谱度众合服务发表于顶刊 Cell (vol. 187)，揭示了裂谷热病毒 (Rift Valley fever virus) 通过组装可编程的 E3 泛素连接酶系统来促进病毒体内高效复制的核心机制，客户高度评价：“测序结果与预期高度一致，想要的靶标互作蛋白全在列表里”。在 Gut 刊发的一项自免疫性肝炎研究中，明确了 A20 调控 KEAP1 泛素化以缓解肝细胞铁死亡的功能。

场景五：表观遗传学、新型/罕见修饰深度挖掘

需求特点：探索组蛋白修饰或特殊氨基酸侧链修饰（非传统磷酸化）对基因转录与染色质构象的影响。

适配产品：定制化 Motif 搜库 + 深度修饰富集与目的蛋白鉴定。

应用案例：在肝病学顶级期刊 Journal of Hepatology (IF: 33) 中，谱度众合协助团队实现了极具挑战性的技术跨越：定位并鉴定了组蛋白 H3Q5 位点上极度罕见的 “5-羟色胺化” (serotonylation) 修饰，阐明了 TGM2 介导的染色质构象重塑；在 Int J Biol Sci 衰老研究中，精准鉴定核蛋白 HMGB1/2 发生非酶促 “N-同型半胱氨酸酰化”，展现了极其深厚的底层质谱谱图解析功底。

场景六：创新药物靶点筛选与共价结合药物开发

需求特点：研发小分子抑制剂或共价结合药物，寻找直接作用的“靶蛋白”，确认药物究竟与底物哪个氨基酸残基（例如Cys, Lys等）形成了共价连接。

适配产品：共价结合药物靶点筛选 (LC-MS/MS & IP-MS)。

应用场景：创新应用修饰质谱技术对大队列“药敏/靶标肽段”进行无偏见深度扫描，精准确定药物具体结合的靶点残基位置，为现代药物化学结构优化、靶向激酶小分子开发及药理学机理确证提供扎实的数据支撑。

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