色谱可以对有机化合物进行有效的分离、分辨，而质谱则是准确鉴定化合物的有效手段。由两者结合构成的色谱—质谱联用技术，可以使样品中的化合物逐个地进入质谱仪的离子源，达到定性定量的目的，常用设别有HPLC、LCMS、LCMSMS、LC-Q-TOF、GC、GCMS、GCMSMS、Py-GCMS、HS-GCMS、GC-Q-TOF、GPC、Tof-SIMS等。

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