药物研发利器-LINCS/CMap比对分析

    Connectivity map（简称CMap）为一个基因表达谱资料库，是由Todd Golub与Eric Lander领导的精英团队，集哈佛、剑桥大学与麻省理工学院众多优秀研究人员所构建，利用小分子药物处理人类细胞后的基因表现差异，建立一个小分子药物、基因表现与疾病相互关联的生物应用资料库。研究团队认为以基因表达谱为所建立之基因、疾病与药物的关联性，可协助学者们在药物开发领域上，快速利用基因表达谱的资料比对出与疾病高关联性的药物、推论大部分药物分子的主要化学结构，并能够归纳出药物分子可能作用的机制方向！
 

服务内容

1、使用华联OneArray获得差异基因；
2、比对Connectivity Map(CMap)资料库中的基因图谱
  - 找寻有相似基因图谱的分子或药物
  - 分析药物功效与机制
3、利用Reverse docking筛选已知或新分子，预测蛋白结合目标；
4、找到的蛋白结合目标，再与差异基因进行Pathway analysis。

其他物种，我们可以提供根据最新Sanger数据库里的miRNA（Sanger miRBase最新版本），以及您的需求，进行自由组合，定制8*15K或8*60K的miRNA芯片。

应用

新药开发

1、了解药物作用机制（Mechanism of action）
2、比较相似药物的enrichment of effects
3、预测副作用
老药新用

1、由相似基因图谱连结未曾相关药物
2、找出新的药物目标或新的作用路径
中草药

1、从复方中找到具功效的分子
2、了解具功效的分子的作用机制
 

案例

图1

图2

台北医学大学及台湾大学研究团队研发的抗癌标靶新药MPT0E028，可明确抑制组蛋白去乙酰酶（HDAC）的活性，有效毒杀癌细胞。此药使用华联Human OneArray得到的差异基因群，经由CMap资料库比对，即成功预测MPT0E028为HDAC inhibitor（图2红框为已知的HDAC inhibitor）。

服务流程

药物研发利器-LINCS/CMap比对分析信息由上海卓灏医药科技有限公司为您提供，如您想了解更多关于药物研发利器-LINCS/CMap比对分析报价、项目、资质、周期、参考标准等信息，欢迎来电或留言咨询。