iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)是AB SCIEX公司于2004年开发的一种定量蛋白质组学研究技术。该技术可以比较许多不同样品中的蛋白质。例如,它可以研究不同病理条件或不同发育阶段的组织样品中蛋白质表达水平的差异。同时,iTRAQ可以准确地定量和鉴定一个基因组中表达的所有蛋白质或一个复杂混合系统中的所有蛋白质。iTRAQ可以使用8种不同的同位素试剂同时标记和比较8种不同的蛋白质样品。标记试剂由报告基团,平衡基团和胺特异性反应基团组成。
TMT(Tandem Mass Tag)串联质谱标记技术是美国Thermo Fisher Scientific开发的一种肽体外标记技术。该技术最多可以使用10个同位素标签来标记多肽的氨基。经过LC-MS/MS分析后,可以同时比较10个不同样品中蛋白质的相对含量。TMT广泛用于疾病标志物筛选、药物作用靶标、动植物抗病或抗逆机制、动植物发育和分化机制等领域。将不同的蛋白质样品变性、还原、烷基化并消化成肽段样品。然后将这些肽段样品用TMT试剂盒标记后合并为一个样品。使用HPRP液相色谱分离合并的样品,并将馏分串联为12个样品。纯化后,通过HPLC-MS分析每个样品。分析数据以获得蛋白质的定性和相对定量信息。