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全基因组重测序简介
全基因组重测序通过对已知基因组序列的物种进行不同个体的基因组重测序和序列比对,可以找到大量的SNP(Single Nucleotide Polymorphism)、InDel(Insertion/Deletion)、CNV(Copy Number Variation)等信息,从而进行个体或群体的基因组的差异性分析,在植物育种研究、遗传进化分析及重要性状候选基因预测方面,具有重要的科研和产业价值。 北京中康博可以帮助您利用有Illumina Hiseq X10等平台进行全基因组重测序,并通过生物信息学的手段,分析不同个体基因组间的差异, 同时完成注释,从而帮助您在全基因组水平上扫描并检测特定人群的重要遗传性状相关位点。 中康博技术优势
● 严格的质控标准:提供整套质控分析,确保数据准确性● 成熟的实验技术:配备有专业的技术操作人员,具有丰富的样品处理和建库经验● 强大的生信分析团队:熟悉各种分析算法和软件;根据客户需求,提供更多个性化分析● 易读性强的数据报告:提供全面的数据及图形内容,同时配备技术人员帮助客户查看数据结果 推荐测序模式
● 测序平台:Hiseq X 10● 测序类型:PE150● 测序深度:150G(50X)或者 300G(100X) 全基因组重测序实验流程
全基因组重测序数据分析流程
样品要求
1.样品纯度:纯度OD260/280在1.8-2.0之间;RNA 应该去除干净。2.样品浓度:最低浓度不低于50ng/µl。3.样品总量:每个样品总量≥500 ng。4.样品溶剂:基因组DNA用TE/水溶解。5.样品运输:DNA低温运输(-20℃);且在运输过程中请用parafilm将管口密封好,以防出现污染;收到样品后,甲方需要对样品进行检测,最终样品的量和纯度,以甲方的检测结果为准。
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