De novo测序也叫从头测序,不需要任何基因序列信息即可对某个物种进行测序。用生物信息学的分析
对测读序列进行拼接、组装,从而获得该物种的基因组序列图谱。随着新一代测序技术的飞速发展,大大降
基因组测序的成本和时间,为研究新物种全基因组序列提供了一个崭新的研究平台。
沃森生物采用umna第二代高通量测序平台和 Pacbio第三代测序结合的方法,对未知物种的个体进行基
测序, Illumina能产生海量的数据,可为动植物基因组组装提供高夏盖度的数据, PacBio第三代测序平台能产
常长的读长,能跨越基因组中高重复、高杂合等复杂区域从而能得到非常好的基因组组装结果。从基因组水
对物种的生长、发育、进化、起源等重大问题进行研究,将加深我们对物种的认识,在发掘重要的功能基因
育优良新品种,加速分子育种进程及相关物种的餐种硏究提供可靠的基础。
2、基因组注释
重复序列分析与注释;
基因预测;
3、动植物比较基因组学与进化分析
基因家族分析
物种系统发育树构建
·基因组共线性分析;
全基因组复制分析。
4、基因组数据库网站的建立
im S, et al. Genome sequence of the hot pepper provides insights into the evolution of pungency in Capsicum species. N
Genet.2014:10.1038
2. Wang X, et al. The locust genome provides insight into swarm formation and long-distance fight. Nat Commun. 2014, 5: 295
3. Venkatesh, et al. Elephant shark genome provides unique insights into gnathostome evolution. Nature. 2014, 505(7482)
动植物基因组DENOVO测序,动植物基因组DENOVO测序
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