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STR介绍 STR(短串联重复序列),又称为微卫星标记或SSR。一般有2-6bp的核心序列串联重复而成,构成了STR基因座的遗传多态性。 STR/SSR具有分布广泛均匀、多态性丰富、遵循孟德尔共显性遗传、信息量大、检测简便等优点,STR/SSR分型高效快捷,结果准确,是非常重要的遗传标记,在遗传制图、连锁性分析、亲子鉴定、疾病基因定位和物种多态性研究等领域有着广泛的应用。上海翼和生物微卫星分型服务: 根据具体实验规模,提供两种检测平台,分别为:适合中低通量检测的多重荧光PCR STR/SSR分型服务和适合高通量的基于二代测序的Hi-STR分型服务。多重荧光PCR的微卫星(STR/SSR)分型服务 上海翼和生物采用通用荧光引物方案,多重PCR扩增STR/SSR位点,利用ABI遗传分析仪对荧光标记DNA片段进行检测,利用分子量内标进行DNA片段长度计算,使得微卫星分型变得高效,快捷,结果更加精确可靠。技术路线:
翼和特色
服务流程A.微卫星(STR/SSR)分型引物筛选 1)客户提供样本以及位点信息; 2)翼和设计相关位点的扩增引物,并合成; 3)预实验抽样小试,摸索并优化反应条件(包括退火温度,镁离子浓度等); 4)3730 XL测序仪电泳 5)Genemapper分析,数据导出;B.大规模分型实验 1)大规模样本位点扩增; 2)3730 XL测序仪电泳; 3)Genemapper分析,数据导出; 4)交付实验报告,包括实验材料,方法,引物序列等;Hi-STR分型服务 Hi-STR结合多重PCR技术和高通量测序技术,对需要检测的位点设计特异性引物,在单管内进行多重PCR扩增,不同的样本以不同的Barcode引物区分。混合样本后,在Ion Proton/illumina 主流测序平台上,对扩增子进行高通量测序。测序结果使用生物信息学方法,实现对STR位点的检测,与传统的凝胶电泳或毛细管电泳相比,可以直接根据序列,准确判断STR位点的重复次数。Hi-STR适用于核心重复区域3bp及以上的微卫星位点,配合各类高通量测序仪,使得STR分型具有更准确、更灵敏的特点,二代高通量测序,可将上千样本和STR位点混合检测,使检测更加高效经济。 技术路线:
本方法适用于动物植物及人类的遗传图谱绘制、QTL定位、生物多样性、动植物SSR位点检测、群体遗传结构等诸多领域。
微卫星(STR/SSR)分型检测服务,微卫星(STR/SSR)分型检测服务
微卫星(STR/SSR)分型检测服务信息由上海翼和应用生物技术有限公司为您提供,如您想了解更多关于微卫星(STR/SSR)分型检测服务报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。
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