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miRNA芯片数据发掘分析
芯片聚类分析
二、microRNA靶基因预测“TargetScanS”,“miRanda (miRBase)”,“miRGen”等数据库预测差异microRNA的所有靶基因。
靶基因GO分析
根据Gene Ontology数据库对靶基因进行功能显著分析,从而筛选显著性功能的靶基因。
靶基因pathway分析
根据KEGG数据库对靶基因进行Pathway分类,并进行显著性分析从而得到显著性的Pathway分类。
构建MicroRNA与基因的调控网络
通过构建MicroRNA与基因的调控网络,可以从中找出hub基因及hub microRNA.
microRNA 、靶基因、转录因子调控网络
microRNA也会受到转录因子调控造成表达差异,通过系统研究转录因子与基因间的调控关系,可以为寻找重要转录因子及重要基因提供线索。
microRNA启动子分析及甲基化位点分析
当microRNA研究日趋火热,越来越多的研究者开始关注microRNA本身甲基化变化。MicroRNA基因的甲基化变化也是造成microRNA表达差异的重要原因。
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