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真菌基因组中编码核糖体RNA的基因有4种,即26S rDNA、5S rDNA、18SrDNA和5.8S rDNA。真菌大亚基上26S rRNA分子,可分为D1、D2、......D12等多个区域真菌大亚基上的26S rDNA分子,可分为D1、D2…D12等多个区域,其中D1/D2区域长度500 bp左右,可用于对真菌进行鉴定。几乎所有已知酵母菌种模式菌株的D1/D2序列已被测定。真菌的ITS (Internal Transcribed Space) 基因,包括ITS1及ITS2两部分,进化速度快,具有多态性,适于对亲缘关系较近的菌株进行区分鉴定。我们可根据26S rDNA大亚基中的保守序列设计引物,PCR扩增未知真菌的26S rDNA D1/D2区或ITS区,进行序列测定并与GenBank中已知的序列进行同源性比较,将未知真菌鉴定到属或种,对真菌菌种进行鉴定。★服务内容:真菌18S rDNA D1/D2区序列分析:PCR扩增真菌18S rDNA D1/D2区片段,长度在500-600 bp左右,只需进行一个测序反应*,即可得到18S rDNA D1/D2区序列信息。该方法尤为适合对酵母菌进行鉴定。真菌ITS区(包括ITS1、5.8S rDNA、ITS2) 全序列分析:PCR扩增真菌ITS区片段,长度在300-1,000 bp左右,依据PCR扩增片段的长度,进行一个或两个测序反应,即可得到ITS区序列信息。★您需要提供的信息:1 试管菌、甘油菌、体积大于500ul的菌液或基因组DNA。2 所送样品可能的分类地位、已知生长性状、分离环境条件、所提供的DNA纯度等。3 真菌样品是否具有致病性和潜在危险,如您的样品具有一定的致病性或具有潜在的危险,请您提供基因组DNA。★服务周期: 30样品以下10-15个工作日内递交结果。如遇到特殊情况,我们会及时与您联系,保证尽早发货。30样品以上依据具体样品数量而定。★服务承诺: 我们提供给您真菌样品的测序锋图,序列比对结果及完整的结果分析报告。★客户须知:1) 我们的一次性收费包括基因组DNA提取,真菌18S rDNA或ITS序列扩增,扩增产物纯化及测序费用。2) 真菌鉴定服务完成后相应的菌株将为您保存1个月,一月后将统一销毁。3) 常温运输时间过长会导致菌体老化,细胞壁难以破碎,因此对于试管菌,建议您使用冰袋运输。4) 如果测序结果出现套峰,视为样品不纯,因实验样品不纯造成的测序套峰,将收取全额实验费用。5) 我们不接受有致病性菌种的鉴定。
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