宏转录组(Metatranscriptome)测序是以特定样品中微生物群落的全部RNA为研究对象,从转录水平上分析微生物群落中活跃菌种的组成以及活性基因的表达情况。宏转录组在进行物种鉴定的同时,也能研究活跃菌种以及高表达基因的组成情况,揭示特定环境因子影响下菌种的适应性以及基因表达可能的调控机制。此外,宏转录组测序研究避开了微生物分离培养的过程,扩展了微生物资源的利用空间,为微生物的转录研究提供了有效工具。
技术优势
适用范围广:宏转录组测序无需对微生物进行分离培养,就可以对样品中的微生物群落进行全面的检测,扩展了微生物研究范围
检测信息全面:直接对环境中所有的微生物转录组进行检测,比微生物个体研究更能反映微生物生存的真实状态
灵敏度高:高通量覆盖,不仅能检测样品中高丰度的微生物,还能发现痕量微生物物种信息
准确度高:直接读取微生物转录组序列,准确性高
数据分析
基本分析高级分析1. 原始数据整理,过滤和质量评估根据客户的具体研究进行的个性化定制2. 与参考宏基因组比对 3. 不同类群表达基因组成分析 4. 转录组表达量计算 5. 差异表达分析 6. 差异表达基因的GO和信号通路分析
数据展示
上图:mRNA转录本的细菌分类分析
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