Reduced Representation Bisulfite Sequencing(RRBS)测序是一种经济的,可实现单碱基分辨的DNA甲基化研究方法。该方法通过酶切DNA特异地富集基因组中的启动子区和CpG岛,实现了低成本的全基因组DNA甲基化谱研究。利用bisulfite处理酶切后的DNA,能够区分未甲基化和甲基化的C碱基,实现单碱基分辨的DNA甲基化分析。
技术优势
单碱基分辨:直接读取甲基化和非甲基化的C碱基,可实现单碱基分辨的甲基化分析
性价比高:有针对性地检测启动子区和CpG岛,以较低的成本实现全基因组甲基化分析
检测范围广:可同时检测全基因组范围内数百万个CpG位点
重复性好:特异性酶切处理确保了极高的重复性,多个样本的覆盖区域重复性高达95%,适用于多个样本间的差异甲基化分析
数据分析
基本分析高级分析1. 原始数据整理,过滤和质量评估CS-RRB-001. 甲基化基因的GO和信号通路分析2. 序列匹配与数据统计CS-RRB-002. 样品间差异甲基化分析3. C碱基的甲基化水平计算CS-RRB-003. 差异甲基化基因的GO和信号通路分析4. 甲基化区域的注释,基因组分布统计
数据展示
上图:单碱基分辨的甲基化分布
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