m5C RNA是近年来发现的一类在tRNA及rRNA高丰度存在的甲基化修饰。利用高通量测序手段验证了非编码RNA以及部分mRNA中m5C广泛存在,但是在不同物种、不同组织中m5C修饰分布图谱尚没有系统性报道。目前对m5C RNA的检测手段主要是用重亚硫酸盐(Bisulfite)处理样品,处理能够将基因组中未发生甲基化的C碱基转换成U,进行PCR扩增后变成T,这样反转录的产物就会出现单点突变,结合高通量测序技术,通过与不处理组进行序列比对,就可以很容易的找出m5C修饰位点。 云序生物具有成熟的m5C RNA-Seq实验平台以及丰富的RNA 甲基化测序经验,可以满足客户对不同样本、不同类型RNA 甲基化测序的各类需求。
技术优势
一站式服务:客户只需提供组织、细胞和RNA,云序生物为您完成m5C RNA-Seq实验服务。
严格的质控:云序生物对m5C RNA-Seq实验每一步骤均设有关键质控,保证客户得到优质数据。
专业的生物信息学分析:云序生物具有强大的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析需求
云序产品
数据分析
原始数据整理,过滤和质量评估序列匹配与数据统计识别RNA甲基化富集区域注释RNA甲基化富集区域识别差异甲基化RNA差异甲基化RNA GO分析差异甲基化RNA KEGG信号通路分析其它更多联合分析
数据展示
上图:m5C的基因组位置分布
云序生物技术服务列表
1. 测序服务
转录组表观遗传组基因组真核生物原核生物miRNA测序细菌sRNA测序(h)MeDIP测序目标序列靶向测序小RNA测序(miRNA, piRNA,siRNA)原核生物mRNA测序RRBS测序外显子组测序lncRNA测序宏转录组测序全基因组甲基化测序人类基因组重测序环状RNA测序原核生物转录组测序ChIP测序16S rDNA测序mRNA测序原核De novo转录组测序RNA pull down宏基因组测序降解组测序 RIP测序 转录组测序 (m5C)RNA甲基化测序 De novo转录组测序 (m6A)RNA甲基化测序
2. 生信服务 & PCR技术服务
生信服务实时定量PCR服务转录组表观遗传组基因组联合分析环状RNA分析DNA甲基化分析基因组分析circRNA-miRNA功能分型PCR芯片lncRNA分析ChIP测序分析微生物菌落分析LncRNA-mRNA环状RNA实时定量PCRmRNA分析 宏基因组分析LncRNA-miRNA-mRNALncRNA实时定量PCRmicroRNA分析 miRNA实时定量PCR mRNA实时定量PCR
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