Small RNA是一类长度为18-30 nt,具有调控功能的非编码小RNA的总称。常见的small RNA主要包括:microRNA、siRNA和piRNA等。Small RNA广泛参与包括细胞生长、分化、凋亡在内的几乎所有生理过程,并与包括癌症在内的各种人类疾病相关。
云序生物Small RNA组测序服务可以在一次实验中同时检测所有small RNA,为研究small RNA的功能和调控机制,或者筛选新的small RNA提供了强有力的工具。此外,云序生物还提供仅针对miRNA的测序服务,有效富集miRNA,在相同成本下提高了miRNA有效数据量和测序深度。详情参见miRNA测序服务。
技术优势
全物种覆盖:无需预知序列信息,可对任意物种的small RNA组进行检测
同时检测miRNA、piRNA和siRNA:在一次实验中同时检测miRNA、piRNA、siRNA和其它small RNA
实时更新的small RNA数据库信息:可随时利用最新的small RNA数据库对数据进行再分析,数据永久有效
灵敏度高:可检测在单个细胞中仅一个拷贝的低丰度small RNA
精确度高:可准确区分单碱基差异的small RNA
数据分析
基本分析高级分析1. 数据过滤和接头序列去除CS-MIR-001. miRNA靶基因预测2. 序列匹配与数据统计CS-MIR-002. miRNA靶基因的GO与信号通路分析3. 已知小RNA(miRNA/siRNA/piRNA)识别,注释和统计CS-MIR-003. miRNA-靶基因GO网络分析4. 小RNA表达量计算CS-MIR-004. miRNA-靶基因信号通路网络分析5. 差异小RNA筛选CS-MIR-005. miRNA上游转录因子分析6. 小RNA表达聚类分析CS-MIR-006. 新miRNA预测 CS-MIR-007. miRNA分子标志物筛选
数据展示
上图:小RNA组成统计
云序生物技术服务列表
1. 测序服务
转录组表观遗传组基因组真核生物原核生物miRNA测序细菌sRNA测序(h)MeDIP测序目标序列靶向测序小RNA测序(miRNA, piRNA,siRNA)原核生物mRNA测序RRBS测序外显子组测序lncRNA测序宏转录组测序全基因组甲基化测序人类基因组重测序环状RNA测序原核生物转录组测序ChIP测序16S rDNA测序mRNA测序原核De novo转录组测序RNA pull down宏基因组测序降解组测序 RIP测序 转录组测序 RNA甲基化测序 De novo转录组测序
2. 生信服务 & PCR技术服务
生信服务实时定量PCR服务转录组表观遗传组基因组联合分析环状RNA分析DNA甲基化分析基因组分析circRNA-miRNA功能分型PCR芯片lncRNA分析ChIP测序分析微生物菌落分析LncRNA-mRNA环状RNA实时定量PCRmRNA分析 宏基因组分析LncRNA-miRNA-mRNALncRNA实时定量PCRmicroRNA分析 miRNA实时定量PCR mRNA实时定量PCR
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