长链非编码RNA(Long non-coding RNA,LncRNA)是一类长度超过200nt,不编码蛋白质的RNA分子。这类RNA分子在表观遗传水平、转录水平以及转录后等水平调控基因的表达,广泛参与各种生理学过程,与癌症、心血管疾病、神经退行性疾病等多种人类疾病密切相关。目前,LncRNA已经取代miRNA成为近几年来最耀眼的明星RNA分子,是国际上的研究热点。
云序生物提供的LncRNA测序服务同时分析特定样品中的所有LncRNA和mRNA,并根据已知数据库和文献对LncRNA进行详细注释,能够帮助客户筛选与特定生物学过程或疾病相关的LncRNA,并为后续的LncRNA功能和机制研究提供极大的便利。
云序特色
全面检测所有LncRNA:约有20%的LncRNA没有Poly(A)尾巴,如果采用Oligo d(T)富集法会丢失这部分LncRNA信息。云序生物拥有市面上最全的,针对不同物种的去rRNA试剂盒,能够保留所有LncRNA信息
适用于降解样品:采用特有的、可适用于降解样品的去rRNA试剂盒,能够最大程度地保留降解样品中的LncRNA信息。尤其适合于临床样品的LncRNA检测
链特异性检测:采用链特异性建库方法,可准确检测反义LncRNA,提供最全面的LncRNA信息
专业化的生物信息学分析:强大的生物信息学团队,满足客户的各类深入数据分析需求
数据分析
基本分析高级分析1. 原始数据整理,过滤和质量评估CS-LNC-001. LncRNA靶基因共表达网络分析(CNC)2. 基因组匹配与数据统计CS-LNC-002. LncRNA靶基因集信号通路富集分析(LncRNA-GSEA)3. LncRNA识别和注释(含mRNA)CS-LNC-003. LncRNA临近靶基因GO和信号通路分析4. LncRNA表达量计算(含mRNA)CS-LNC-004. LncRNA-miRNA-mRNA互作网络分析5. 差异LncRNA筛选(含mRNA)CS-LNC-005. LncRNA上游转录因子分析6. 差异mRNA的GO和信号通路分析CS-LNC-006. 新LncRNA预测 CS-LNC-007. LncRNA分子标志物筛选
数据展示
上图:LncRNA-miRNA-mRNA网络图
云序生物技术服务列表
1. 测序服务
转录组表观遗传组基因组真核生物原核生物miRNA测序细菌sRNA测序MeDIP测序目标序列靶向测序小RNA测序(miRNA, piRNA,siRNA)原核生物mRNA测序RRBS测序外显子组测序lncRNA测序宏转录组测序全基因组甲基化测序人类基因组重测序环状RNA测序原核生物转录组测序ChIP测序16S rDNA测序mRNA测序原核De novo转录组测序 宏基因组测序RIP测序 降解组测序 转录组测序 De novo转录组测序
2. 生信服务 & PCR技术服务
生信服务实时定量PCR服务转录组表观遗传组基因组联合分析环状RNA分析DNA甲基化分析基因组分析circRNA-miRNA功能分型PCR芯片lncRNA分析ChIP测序分析微生物菌落分析LncRNA-mRNA环状RNA实时定量PCRmRNA分析 宏基因组分析LncRNA-miRNA-mRNALncRNA实时定量PCRmicroRNA分析 miRNA实时定量PCR细菌sRNA分析 mRNA实时定量PCR宏转录组分析
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