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GC-MS非靶向代谢组
代谢组学是研究生物体系(细胞、组织或生物体)受刺激或扰动后代谢组的变化的科学,是探究生物现象结果的科学。
气相色谱质谱联用(GC-MS)是较为成熟的色谱-质谱联用技术之一,由于其分辨率高、灵敏度高、重现性好,具有大量标准代谢物谱图库,且成本相对低廉等特点,适合分析相对分子质量小(500Da以内)、低极性、低沸点的代谢物。
技术流程
技术优势
技术成熟稳定,灵敏度高、动态范围宽有标准数据库,更易定性针对性的预处理方案,适用于多种性质的小分子检测
案例展示案例一 美大豆猝死综合症病菌感染早期的大豆根系代谢组学研究
实验材料抗病能力不同的两个大豆品种(敏感型和部分抗SDS感染型)
研究流程
研究结论通过疾病的进展曲线面积(AUDPC)变化发现,症状最大差异出现在接种后第25天GC-MS对大豆根样品代谢物分析发现,接种后7天一些氨基酸和多胺类物质差异较大代谢物主成分分析结果表明,与首要成分相关的变量主要是氨基酸,说明在感染的早期阶段,病原菌诱导易感植物积累一些氨基酸基于GC-MS代谢组学可用于品种相关的快速SDS表征
参考文献María M.Scandiani. et al., Metabolic profiles of soybean roots during early stages of Fusarium tucumaniae infection. 2015, J. Exp. Bot.
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前 言今天分享给大家一篇,运用了鹿明生物GC-MS代谢组和蛋白iTRAQ技术的客户文章,该文由南京大学赵丽娟老师发表在EST(Environmental Science & Technology)杂志。基本信息文章题目:C60 Fullerols Enhance Copper Toxicity and Alter the Leaf Metabolite and Protein Profile in CucumberC60富勒醇对铜协迫黄瓜叶片组织
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