肠道菌群在维持机体正常功能中的作用已经越来越受到重视,最近研究发现,肠道菌群可以调节机体的情绪、认知、疼痛和睡眠等,并与阿尔茨海默病、帕金森、焦虑抑郁和孤独症等多种疾病密切相关,也是多种神经系统疾病发生和发展的关键调节者,相关领域的研究如火如荼,取得的成绩斐然。
宏蛋白质组学是一门新型科学,它运用质谱技术规模化地采集自然界微生物种群的蛋白质信息,并结合多种组学数据,开展微生物种群的遗传特征及其生物功能的研究。
实验流程
应用领域
案例分析
肠道微生物菌群的改变与炎症性肠病(IBD)的发病机制有关,但介导宿主-微生物群相互作用的因素尚不清楚。本文应用宏蛋白质组学技术对来自儿科IBD患者粘膜腔样本进行了人和微生物菌群蛋白特征的分析。结果发现,与氧化应激反应相关的微生物蛋白在IBD病例中上调。特别是在IBD病例中,与氧化抗菌活性相关的人类蛋白表达增加,并与微生物功能的改变相关。此外,还发现这些人类蛋白中有许多存在于分离的游离细胞外囊泡(EV)中,并显示出丰富值的改变。最终结果表明肠外囊泡蛋白组的改变与IBD中宿主-微生物群的异常相互作用有关。
参考文献
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[2]. Aron-Wisnewsky, J., and Clément, K. (2016). The gut microbiome, diet, and links to cardiometabolic and chronic disorders. Nat. Rev. Nephrol. 12, 169–181. doi: 10.1038/nrneph.2015.191
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