您好,欢迎您查看分析测试百科网,请问有什么帮助您的?
如果企业客服不在线,也可拨打400电话联系。或者发布求购信息
STRING是收录多个物种预测的和实验验证的蛋白质-蛋白质互作的数据库,包括直接的物理互作和间接的功能相关。结合差异表达分析结果和数据库收录的互作关系对,构建差异表达蛋白互作网络。分析过程中将差异表达蛋白映射到STRING数据库中,获得差异蛋白的相互作用关系信息。由于STING数据库除了包含有实验数据、从PubMed摘要中文本挖掘的结果和综合其他数据库数据外,还有利用生物信息学的方法预测的结果,我们从搜索结果中筛选出综合打分大于0.4(Medium)的蛋白互作关系对,并采用合适的生物信息学分析软件对相互作用结果进行可视化。结果如图所示:
图1 差异表达蛋白互作信息不同来源的证据(Evidence)图2 差异表达蛋白互作强度信息图(Confidence)
注:圆圈(node)表示蛋白质,不同颜色表示不同的蛋白质,圆圈里是蛋白的三维结构。直线表示蛋白质之间的相互作用关系。线越粗表示二者的互作关系越强。暗色的线表示在evidence view的圆中有关系,但在actions图中没有关系。
图3 差异表达蛋白之间不同的作用模式(Actions)
蛋白质相互作用网络分析,蛋白质相互作用网络分析
蛋白质相互作用网络分析信息由北京百泰派克生物科技有限公司为您提供,如您想了解更多关于蛋白质相互作用网络分析报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。
蛋白分子量测定
群组论坛--近红外(NIR)
您可能要找:百泰派克蛋白质组/多组学蛋白质相互作用网络分析价格蛋白质相互作用网络分析蛋白质组/多组学参数
Copyright ©2007 ANTPedia, All Rights Reserved
京ICP备07018254号 京公网安备1101085018 电信与信息服务业务经营许可证:京ICP证110310号