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非靶向代谢组学(Untargeted Metabolomics),也称为非目标代谢组学或发现代谢组学,无偏向性地对所有小分子代谢物同时进行检测分析的代谢组学。检测平台包括核磁共振(NMR)、气相色谱-质谱(GC-MS)、液相色谱-质谱(LC-MS)等,研究人员可以根据研究的目的、样本的类型等选择合适的分析平台,亦可以同时运用多种平台进行分析,达到更加完善、全面的研究目的。 研究流程:应用范围:医学研究:疾病标志物筛查,疾病的诊断和分型,疾病复发诊断,病因与病理机制探究,临床疗效评价,药物毒理学评价生命科学研究:非生物环境关系研究,植物与微生物,在表型鉴定中的应用,代谢途径及功能基因组研究,药用植物研究中的应用帕诺米克优势:(1) 拥有多种先进检测设备 QTM7890A-5975C气质联用仪、Thermo LTQ Orbitrap XLTM组合式质谱仪等代谢组学仪器平台。(2) 拥有多个商业数据库 拥有多个商业数据库,同时建立了超过两千个标准品数据库,使定性更加准确。(3) 配套设施齐全 多元化的配套软件、自定义数据分析系统、文献分析系统助您轻松完成科研工作。(4) 提供个性化服务 拥有专业的生物信息团队和大型计算机,可以为合作伙伴提供个性化的生物信息分析服务。(5) 实验结果可靠 分析过程采用严格的方法验证步骤,多重质控保证实验可靠。(6) 完善的售后服务 完善的售后服务,从报告解读至个性化分析,帕诺米克可全程提供高效高质量的服务。实验设计:非靶向代谢组学用于检测生物学样品的总体代谢物的信息并进行定量,对不同处理或生理状态的样品进行分组,并通过非靶向代谢组学的方法进行检测,找到不同组别的差异代谢产物,用于后续生理机制的研究。样本要求:动物组织 ≥ 0.2g血清、血浆 ≥ 0.3ml尿液 ≥ 0.25ml唾液≥ 1ml粪便 ≥ 0.3g细胞 ≥ 107个植物组织 ≥ 2g 微生物 ≥ 0.12g土壤≥ 10g样本的保存:液氮 或 -80℃保存样品运输:干冰运输生物学重复:为排除个体差异,建议对于临床样品,生物学重复 ≥ 30;对于培养的细胞、微生物、动物模型及植物,生物学重复 ≥ 8。分析内容:案例分享:【项目文章】HGF-MET信号通路协调肝癌代谢和自噬以抵抗化疗,探索出了一条解决肝癌化疗耐药性的新方法发表时间:2019年期刊:Autophagy影响因子:11.059 HGF刺激并促进了瓦博格效应和谷氨酰胺水解,从而加速了多种肝癌细胞的发生;丙-酮酸脱氢酶复合物(PDHC)和GLS/GLS1是HGF活化MET激酶的关键底物;MET介导的磷酸化抑制了PDHC活性,但是却激活了GLS,从而促进癌细胞的发生和代谢。作者证实了Y1234/1235去磷酸化MET与临床肝癌的自噬相关。最后,MET抑制剂和自噬抑制剂的联合应用显著提高了肝癌在试管和小鼠的治疗效率。 图1 肝细胞生长因子促进肝癌代谢和生物发生 图2 HGF-MET信号通过PDHC和GLS促进肝癌代谢和生物发生 图3 HGF-MET靶向药物通过诱导自噬来调整肝癌的生物发生参考文献:Huang X et al., The HGF-MET axis coordinates liver cancer metabolism and autophagy for chemotherapeutic resistance. Autophagy. 2019 Jul;15(7):1258-1279.
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